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University of California, San Franciscoらのグループは、新型コロナウイルス（SARS-CoV-2）B.1.427/B.1.429 変異株の感染力や中和抗体への影響について報告しています。
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33991487/

有名なSARS-CoV-2の変異は、B.1.1.7（英国株）、B.1.351（南アフリカ株）、そしてP.1（ブラジル株）であります。B.1.1.7変異株は、N501Y変異によって、B.1.351 と P.1変異株は、N501Y変異に加えて、E484K、K417N/K417T変異を持っていることが大きな特徴です。
B.1.427/B.1.429変異株は、2020年9月からカリフォルニアで蔓延し出した変異株であり、Spikeタンパク質をコーディングしている領域に存在するS13I、W152C、L452R変異が特徴であります。なお、L452R変異は、ACE2に対するRBDに存在します。

これらの変異株は、変異前の株に比べて、18.6%～24% 感染力が増大しており、中和抗体の力価も、回復期患者のそれで4.0～6.7倍減少し、ワクチン接種でも2倍ほど減少することが確認されました。

この理由については、RBDの構造変化が関係しているとされ、L452はF490やL492と共にRBD上に疎水性パッチを形成することが背後にあると考えられました（下図参照）。

順天堂大医学部らのグループは、乳癌の再発群と非再発群の間に、特徴的な糖鎖修飾の違いがあることをレクチンマイクロアレイを用いて発見しました。
https://journals.plos.org/plosone/article?id=10.1371/journal.pone.0250747

乳癌は女性の最も一般的な悪性腫瘍の一つです。トリプルネガティブ乳癌（TNBC）は、再発しやすいサブセットであり、全体の乳癌の15～20%を占め、エストロゲン受容体やプロゲステロン受容体の発現を欠き、ヒト上皮成長因子受容体-2（HER2）が過剰発現していることが特徴となっています。このTNBC患者には、ホルモン治療や抗HER2治療が効かないことから、現状では細胞毒性の化学療法が唯一の選択肢となっています。

著者らは、Fucα1-2Gal や β-GalNAc構造を持つ糖鎖にアフィニティーを持つレクチンTJA-IIの信号が、再発したTNBC患者から外科手術で摘出した組織標本からの細胞抽出物において高くなっていることを発見しました。そして、組織標本のTJA-II免疫染色によっても、TNBC患者と非TNBC患者の間におけるこの違いを確認しました。他２つのレクチン、WFAとBLP、も同じような傾向を示すことから、β-GalNAc構造を持つ何らかの糖タンパク質がこの背後にあると考えられました。次の研究段階は、再発性のTNBC治療に向けて、この糖鎖修飾構造を持つターゲットとなる糖タンパク質を見つけることです。

Vrije Universiteit Amsterdam, Netherlandsのグループは、樹状細胞にα2-3Siaの刺激が入った場合のシグナルパスの変化について議論しています。
https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fimmu.2021.673454/full

樹状細胞（DC）は、細胞膜上のパターン認識受容体（PPR）によって、非常に多様な病原菌らの異物を認識することが出来、MHCとともにその抗原を細胞膜上に提示することによってT-細胞を活性化させます。
シアル酸は、癌の免疫制御において重要な役割を果たしていることが認識されてきています。癌が進行するにつれて、癌細胞の周りに免疫抑制的な微小環境を作り上げるために、シアル酸の修飾を増加させることがしばしば見られます。また、病原菌が免疫を逃れて生き残るために、シアル酸修飾を増加させるという例も良く見られます。

著者らは、樹状細胞において、LPSの刺激下で、α2-3Siaの刺激が入ったときに、リン酸化タンパク質、キナーゼ活性、そしてまたJAK-STATシグナルパスに如何なる変化が起こっているかを調べました。LPSはリポ多糖の略であり、免疫を活性化する場合のモデル物質（エンドトキシン）として良く使用されます。

結果を概観すると、次のようなことが言えます。
α2-3siaの刺激はリン酸化タンパク質を増やすのですが、α2-3sia とLPSで同時に刺激をすると、リン酸化タンパク質が減少します。α2-3Sia刺激を受けた樹状細胞では、α2-3SiaとLPSで同時に刺激したそれに比べて、ERK, AKT1, PKCB, GSK3, PKCD, PAK1, PKA, GSK3, GRK, IκB, RAF1らのキナーゼが減少します（因みに、これらのキナーゼはケモカインのシグナルパスに関係しています）。更に、α2-3siaの刺激は、JAK-STATシグナルパスに、STAT3やSTAT5Aのリン酸化を弱めることによって影響を与えていました。

ここで起こっている物事は非常に複雑なのですが、これらの変化は、炎症性サイトカインであるIL-12を減少させ、抗炎症性サイトカインであるIL-10を増加させるようであり、α2-3Siaの刺激は、結果として全体的に炎症を抑える方向に系を動かすことが示されました。

IRCCS Azienda Ospedaliero-Universitaria di Bologna, Italyのグループは、COVID-19患者とCOVID-19陰性者の間の肺細菌叢の違いを研究しています。
https://www.nature.com/articles/s41598-021-89516-6

集団が似ているか？似ていないか？何が集団の特徴であるのか？を議論する為に、いろいろな指標が工夫されています。
類似度パーセント解析では、COVID-19患者の肺細菌叢は、シュードモナス属の総体的な高さにあり、COVID-19陰性者においては、いわゆる肺共生菌（インフルエンザ菌、ベイロネラディスパー菌、カルノバクテリア属、ポルフィロモナス属、連鎖球菌）の増加が特徴と考えられました。
一方、線形判別分析では、COVID-19患者の肺細菌叢は、シュードモナス属、スフィンゴバクテリア属、クロストリジウム属、アシネトバクター、エンテロバクターが特徴とされました。

これらの分析指標に共通して現れているのは、シュードモナス属であり、このことは多剤耐性を持つ日和見グラム陰性菌がCOVID-19患者で増加していることを意味し、COVID-19患者では、通常の肺共生菌が逆に減少しているという事が特徴になりそうです。

北海道大学らのグループは、ACE2とTMPRSS2の発現に対して、トール様受容体（TLR）のアゴニスト、及びフルチカゾン点鼻薬（FP）が如何なる影響を与えるかについて報告しています。
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC8107375/

SARS-CoV-2の感染については、宿主細胞表面に存在する二つのタンパク質、angiotensin-converting enzyme 2（ACE2）、及びtransmembrane protease serine 2（TMPRSS2）が主要な役割を果たしているとされています。著者らは、自然免疫のシグナルパスの活性化がACE2やTMPRSS2の発現に如何なる影響を与えるか？そしてまたFPの投与がどんな影響を与えるのか？について研究しています。

実験細胞として、鼻腔粘膜から取得されたヒト鼻腔上皮細胞（HNECs）が使用されました。HNECsをPoly(I:C) で刺激しました。Poly(I:C) はdouble-stranded RNA (dsRNA) であり、ウイルス感染のモデルにおいて、しばしばTLRsのアゴニストとして使用されます。

ACE2とTMPRSS2の発現レベルは、免疫染色らによって評価されました。ACE2の発現量は、顕著にPoly(I:C) の刺激によって上昇しましたが (2.884±0.505-fold change vs. untreated cells, p=0.003)、TMPRSS2に関しては統計的な誤差の範囲で顕著な差はみられませんでした。このPoly(I:C) 刺激によって発現上昇したACE2は、FPの投与によって抑制されることが示されました (0.405±0.312-fold change vs. Poly(I:C)-treated cells, p=0.044)。

FPがSARS-CoV-2の感染を押さえる効果があるのかどうかについては、更にin vivoでの研究が必要です。

Stanford University School of Medicineらのグループは、妊娠中にSARS-CoV-2に感染した場合の胎児における免疫について報告しています。
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33972953/

幼児の病原菌に対する免疫というのは、母体での効果的な抗体の産生と、その胎盤を通じての母体の抗体の胎児への移動、更に胎児における受動免役の継続性にあります。著者らは、SARS-CoV-2に感染した母親からの抗体の移動率について、懐妊期間における母体のSARS-CoV-2感染時期との関係性、新生児のSARS-CoV-2感染に対する抗体応答、及び受動免役の継続性について研究しています。

本研究は、SARS-CoV-2に感染した145人のは母親と、その147人の胎児に対して行われました。125対の母体および臍帯血サンプル中の抗体には顕著な正の相関関係が認められました（Rs=0.93, p<0·0001）。胎盤を通じての抗体移動率は、77のIgG陽性の母親と胎児の組で計算され、転移率の中央値は1.0（95% CI 0.86-1.09）となりました。母親が重度であった場合に、無症状や軽度／中度の場合に比べて、抗体移動率が顕著に高くなっていました（重度 vs 無症状：1.6 vs 1.0, p=0.003）及び（重度 vs 軽度／中度：1.6 vs 0.9, p=0.002）。

最初にPCR検査で陽性が判明した時期から、出産までの経過時間ごとの抗体の移動率は、0.6（<60日, n=22）、1.2（60-180日, n=27）、そして0.9（>180日, n=5）となりました。この結果は、胎盤を通して行われる抗体の移動が、出産の2か月以上前にSARS-CoV-2の感染が起こっていた場合により高くなることを示しています。つまり、このことは、妊娠中の母親に対するワクチン接種の最適なタイミングを決定する上で非常に意味のある結果だと考えられます。

University of Alberta, Canadaらのグループは、Gal-9がCOVID-19の優れた診断マーカーになり得ると報告しています。
https://mbio.asm.org/content/12/3/e00384-21.long

自然免疫細胞は、非常に多岐に渡り病原菌を認識し、免疫応答をします。例えば、活性化したマクロファージや単球は、サイトカインを多量に分泌します（IFN-γ, IL-1, IL-6, TNF-α, IL-18など）。同様に、好中球は好中球細胞外トラップを放出し、NK細胞は病原菌殺傷の第一線で働くと同時に免疫反応の継続にも関与し、サイトカインストームを増幅します。大まかに言えば、基礎疾患で弱くなった自然免疫に、老齢化による免疫反応の乱れが加わり、ウイルス感染が引き金となり、サイトカインストームを引き起こしていると言えます。

Galectinは、細胞の分化、信号伝達、免疫調整などいろいろな生命現象に関わっています。本研究は、Galectin、特にGal-9にフォーカスを合わせ、それがCOVID-19という病理の中でどのように位置づけされるのかを探る為に、120名のSARS-CoV-2感染者と59名の健常者を含むコホート研究として行われています。

健常者に比べて顕著に高レベルのGal-9がCOVID-19の血漿中に存在しました（0 から 2,042 pg/ml）。更に、血漿中のGal-9は、COVID-19の重症者で中度／軽症者よりも顕著に高発現していました（重症者：1,950 から 125,510 pg/ml）そして（中度／軽症者：1,000 から 83,717 pg/ml）。 ROC解析からは、カットオフ値＝2,042 pg/mlとして、特異度／感度（95%）にて、COVID-19患者を、健常者、HIV感染者、そして癌患者から判別することが可能であることが示されました。COVID-19患者の血漿中Gal-9が、HIV感染者、デング熱感染者、インフルエンザ感染者、更には癌患者のそれよりも高発現しているというのは、非常に興味深い事柄です。

Gal-9が如何なる細胞種から産生され、どのようにCOVID-19のサイトカインストームに至る自然免疫応答に関わっているのか？は非常に興味深く、著者らの一連の実験結果からは、下記のようなモデルが提唱されました。SARS-CoV-2の感染にてダメージを受けた肺上皮細胞からGal-9が分泌される。それが肺胞マクロファージを活性化し、活性化されたマクロファージやアポトーシス細胞から炎症性サイトカインやGal-9が分泌される。更に、Gal-9は単球や他の免疫細胞も活性化し、サイトカインストームのオーケストラに直接的に加わる。