月: 2021年12月

Molecular and Cellular Modeling Group, Heidelberg Institute for Theoretical Studies (HITS), 69118 Heidelberg, Germanyらのグループは、分子動力学シュミレーションを用いて、ヘパリンのSARS-CoV-2感染抑制には、３つの役割があると述べています。 https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34929169/ ヘパリンのSARS-CoV-2感染抑制には、以下の３つの働きがあります。 (1) ヘパリンは、両方のコンフォメーション（OPENとCLOSE）でSpikeのS1/S2-ヘパリン結合ドメイン（HBD）に結合し、フューリンの切断を防ぐ、 (2) Close状態のSpikeのOpen化と活性化を妨げる、 (3) RBD-HBDを直接マスキングしながら、RBDの動きを止める。

Department of Plant Pathology, Washington State University, Pullman, WA, USAらのグループは、小麦の遺伝子型とその成長段階が根圏細菌叢の形成に影響し、病原菌R.solani AG-8の土壌抑制効果が大幅に変わることを示しました。 https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34925393/ 近年、根圏細菌叢は大きな注目を集めており、持続可能な農業システムを強化する為に、これら根圏細菌叢を操作することに焦点を当てた多くの研究が行われています。これに関連して、植物の遺伝子型が様々な農業生態系で特定の結果を誘因する細菌を引き付けるであろうというアイデアから、植物遺伝子型特異的な根圏細菌叢の制御という考え方が着目されています。 この研究では、植木鉢での実験条件下において、6種類の冬小麦遺伝子型（Eltan、Madsen、Hill81、Lewjain、PI561725、PI561727）の根圏細菌叢における変化が評価され、培養日周期の増加とともに、小麦遺伝子型に特異的な変化が根圏細菌叢に現れることが示 […]

Division of HIV/AIDS and Sex-transmitted Virus Vaccines, Institute for Biological Product Control, National Institutes for Food and Drug Control, Beijing, Chinaらのグループは、SARS-CoV-2 オミクロン変異株に対するCOVID-19回復期患者（28名）の血清の中和活性を評価しました。 https://www.tandfonline.com/doi/full/10.1080/22221751.2021.2017757 32個の変異すべてを含むSARS-CoV-2 オミクロン Spike（PV-オミクロン）を発現する新しい疑似型ウイルスを構築し、このPV-オミクロンに対する回復期患者の血清（28名のCOVID-19患者からの回復期血清）の中和活性が測定されました。中和活性のED 50、および参照株D614Gと比較した結果も評価されました（下図参照）。デルタ株に比べるとオミクロン株は、中和活性が5.4倍ほど下がっているようです。

National Institute of Allergy and Infectious Diseases, National Institutes of Health, Bethesda, MD, USAらのグループは、SARS-CoV-2 オミクロン変異株の既存のCD8+ T細胞免疫に対する影響を調べています。 https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC8669839/ この研究では、52人のCD8 + T細胞が標的とする以前に同定されたSARS-CoV-2ウイルスのエピトープが、新たな変異株オミクロンで変異しているかどうかを調べています（n = 50 変異）。何故ならば、オミクロン株がどの程度まで既存の獲得免役応答に感受性があるかどうかを見極めることが非常に重要だからです。 T細胞関連の免疫反応は、個々人においても幅広く適応性のある応答であり、個人間のHLAハプロタイプという多様性もあることから、一般的に言って、ウイルスがそう簡単にT細胞免疫から逃れられるものではありません。 本被験集団においては、オミクロン変異体（n = 50）に […]

School of Life Sciences, Faculty of Medicine and Health Sciences, University of Nottingham, Nottingham, UKらのグループは、緑膿菌バイオフィルムによる慢性感染時の免疫応答の調節におけるC型レクチンの潜在的な役割について報告しています。 https://www.nature.com/articles/s41522-021-00257-w 緑膿菌（シュードモナス・アルギノーザ）は、切り傷や火傷の後に急性感染症を引き起こし、持続性の肺疾患や免疫力が低下している患者に慢性感染症を引き起こす日和見病原菌です。 本研究で、幾つかの事柄が明確になっています。 (i) 緑膿菌が、DC-SIGN (CD209)によって強く認識され、MR (CD206) や Dectin-2によって弱く認識される、 (ii) 緑膿菌のバイオフィルムを構成する糖鎖、特に高分子量のそれに、DC-SIGN、MR、Dectin-2が結合する、 (iii) これらバイオフィルムが、DC-SIGN、MR、Dectin-2 の機能に […]

Division of Laboratory Sciences, National Center for Environmental Health, Centers for Disease Control and Prevention (CDC), Atlanta, GA USAらのグループは、wild typeのSARS-CoV-2（S-614D）とその変異株（S-614G）の間でのN型糖鎖プロファイルの変化について報告しています。 https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC8651636/ SARS-CoV-2 Spikeタンパク質における22個の潜在的なN型糖鎖修飾サイトの内、21箇所について、糖鎖修飾サイト特異的な不均一なN型糖鎖の分布とぞの存在量を、α溶菌プロテアーゼ、トリプシン、キモトリプシンの組み合わせによって切断された糖ペプチドの質量分析にて評価しています。 S-614G変異体の分析により、幾つかのN型糖鎖修飾サイトにおいて、S-614Dで見られるものとは異なるN型糖鎖が発現していることが分かりました。 21個の検出および […]