緑茶のカテキン(没食子酸エピガロカテキン)がコロナウイルスの付着を阻害する

Department of Biomedical and Molecular Sciences, Queen’s University, Canadaのグループは、緑茶カテキン、エピガロカテキンガレート(EGCG)は、コロナウイルス一般(CoVs)に対する付着阻害剤である可能性があると報告しています
https://www.nature.com/articles/s41598-022-17088-0

本研究においては、ヒトの季節性および高病原性コロナウイルスの侵入に対するEGCGの阻害活性が評価され、その特徴付けが行われています。ここにおいて、EGCGが、広範囲のコロナウイルスが生理学的に関連するヒト肺上皮細胞へのコロナウイルスの侵入を阻害することが実証されました。更に、EGCGは、複数のヒトコロナウイルスの細胞表面への結合を阻害し、この天然産物が、細胞表面ヘパラン硫酸への一次付着など、コロナウイルスの付着という高度に保存されたステップを阻害することを示唆しています。
SARS-CoV-2に焦点を当てると、EGCGは、ヘパラン硫酸の構造類似体であるヘパリンへのウイルス付着を競合的に阻害することが示されました。これらの発見は、コロナウイルスに対するEGCGの抗ウイルスメカニズムの我々の理解をさらにサポートし、潜在的な将来の新型コロナウイルスを含む多様なコロナウイルスによる感染を防ぐための改良された抗ウイルス分子の開発に際し、高度に保存された抗ウイルス標的を特定するものです。

がん特異的なHigh mannose型糖鎖を認識するレクチン-Fc融合タンパク質(すなわち、レクティボディ)は、がん治療における有用な治療薬となる

Department of Pharmacology and Toxicology, University of Louisville School of Medicine, KY, USAらのグループは、がん特異的なHigh mannose型糖鎖を認識するレクチン-Fc融合タンパク質(すなわち、レクティボディ)は、がん治療において有用な薬剤となり得ると報告しています。
https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/pbi.13902

Avaren-Fc (AvFc) は、ニコチアナ ベンサミアナ(植物のタバコ)で産生されるレクチン-Fc 融合タンパク質 (すなわち、レクティボディ) であり、がん関連のHigh mannose型糖鎖を選択的に認識します。AvFcの糖鎖改変体 (AvFcΔXF) は、コアα1,3-フコースおよびβ1,2-キシロース残基を含む植物に特有な糖鎖を除去したものとして開発されました。これらの糖鎖の除去が成功したことは、HPLCを使用した糖鎖分析によって確認されました。

本研究においては、AvFcΔXF が in vitro でより強力なADCC応答を誘導し、in vivoでの癌転移モデルと同様に側腹部腫瘍モデルの両方でマウスB16F10メラノーマの成長を遅らせることが実証され、High mannose型糖鎖が癌治療における有用な創薬ターゲットのバイオマーカーとなる可能性を示唆しています。

ここで、AvFcΔlec は、糖鎖結合特異性を欠く変異体を意味します

コーヒーの葉からの抽出物がSARS-CoV-2に対する優れた感染阻害剤となる

Graduate Institute of Biomedical Sciences, China Medical University, Taichung, Taiwanらのグループは、コーヒーの葉からの抽出物は、SARS-CoV-2の5つの変異株(アルファ、ベータ、ガンマ、デルタ、およびオミクロン株)が宿主細胞に侵入するのを効果的に抑制したと報告しています。
https://www.ijbs.com/v18p4677.htm

下図のように、100μg/mlのコーヒーの葉からの抽出物は、5つの変異株(アルファ、ベータ、ガンマ、デルタ、およびオミクロン株)から作られた偽ウイルスSARS-CoV-2の感染に対して有意な抑制効果を示しました。

コーヒーの葉の抽出物中には、カフェイン、CGA、キナ酸、マンギフェリンを含む4つの主要な化合物が同定されました。 ACE2 TR-FRETアッセイを使用して、スパイク-ACE2相互作用の阻害効果を評価したところ、4つの主要な化合物にを用いた処理がSpike-ACE2の活性を阻害する可能性があることが実証されました。化合物の性質上、マンギフェリンとCGAはDMSOに可溶であり、カフェインとキナ酸は水溶性です。

イネの根圏:アルスロバクター属が優れた植物成長促進細菌となる

Department of Life Science, Dongguk University-Seoul, Goyang 10326, Koreaのグループは、アルスロバクター GN70をイネの根圏に接種することで、シュートの長さ、根の長さ、新鮮な植物重量、および乾燥した植物重量が有意に増加したと報告しています。
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC9228311/

この研究では、培養法で504株の根圏細菌を分離し、各株の植物成長促進特性がテストされました。IAAの産生量、植物成長促進特性、および病原性微生物に対する拮抗作用の観点から、アルスロバクター GN70が、実験室および温室条件下でですが、イネへの接種に最適として選択されました。GN70菌は根に効率よく定着し、細胞外高分子マトリックスを生成し、イネの成長、側根、および重量を促進しました。また、このGN70菌は、植物およびヒトの病原体に対して拮抗作用を示すことも分かりました。

GN70と命名されたアルスロバクターは、Sphingomonas、Ideonella、Burkholderia、およびAgromycesを含む他の植物成長促進細菌の中で、最も高いIAAの産生量(50.3 µg/mL)を示しました。
アルスロバクター GN70は、下図に示すように、イネの根の表面に効率よく定着し、コロニーを形成します。

(a) アルスロバクターのコロニー形成, (b) コントロール

アルスロバクター GN70は、細胞外高分子マトリックスを産生し、これは、水分を保持したり、土壌の水分保持能力を高めて、水不足のストレス下でバクテリアや植物の根を助けることができます。バイオフィルムを形成する能力は、細菌の生存を強化し、さまざまな植物成長促進細菌の持つ関連メカニズムを通じて植物の成長も強化します。 GN70は、植物成長促進剤、植物病原菌の抑制剤、および水不足ストレスの緩和剤として利用できます。GN70の抗真菌活性は、イネの小穂腐敗病を引き起こすFusarium proliferatum KACC 44025に対して優れた拮抗作用を示しました。

アルスロバクター GN70を接種したイネの種子の場合、植物成長促進効果は顕著であり、t検定に基づいて評価した結果、シュートの長さ、根の長さ、新鮮な植物重量、および乾燥した植物重量がそれぞれ143.5%、83.5%、112.1%、および256.7%と大幅に増加していました。

農薬に耐性を持つ植物生育促進根圏細菌:シュードモナス PGR-11

Department of Biology, College of Science and Humanities, Prince Sattam Bin Abdulaziz University, Saudi Arabiaらのグループは、農薬のストレス下でも植物の生長を即するすることが出来る農薬耐性を持つシュードモナスの能力について報告しています。
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC9200474/

合成化学肥料や殺菌剤などの農薬の使用によって、過去40年間で農業生産性が飛躍的に向上しました。食料の需要の高まりに対応するため使用された化学肥料や農薬は、しかしながら、環境を汚染し、土壌生物や花粉交配に一役買う昆虫らに害を及ぼしてきました。更には、化学物質の過剰利用は作物を病気にかかりやすくし、土壌の肥沃度の低下も招きました。

植物の成長は、植物ホルモンの産生、リンの利用可能性の改善、およびより多くの水と栄養素を吸収するための植物の根系の拡大により、植物の成長を促進する根圏細菌(PGPR)によってプラスの影響を受けます。幾つかの土壌細菌は、長期間の曝露後に農薬耐性を示し、農薬で汚染された地域を効率的に修復するために使用できます。農薬を分解するそれらの能力は、有害な化学物質を環境から除去し、汚染を制御することを可能にすために非常に重要です。

根圏細菌の農薬耐性は、様々な濃度の殺菌剤(CBZM、TBZL、MTXL)で処理された最小塩類培地(MSA)で分離株を成長させることによってテストされました。 緑豆の根圏からの分離株の中で、シュードモナス PGR-11は、CBZM、TBZL、MTXLのそれぞれ800、1600、1200 μg/mLの高濃度でも生き残る唯一の根圏細菌分離株でした。シュードモナス PGR-11は、テストされた殺菌剤に耐える最高の能力と、植物成長促進物質(シデロホア、IAA、EPS、HCN、およびアンモニア)に対する高い産生能力という観点から特に選択されました。

緑豆の収量は、これら試験農薬の濃度が増加するにつれて大幅な低下を示しました。例えば、MTXL 1000μg/kg土壌では、鞘の数、鞘の収量、種子の数と収量、および緑豆のタンパク質含有量は、それぞれ最大で90、78、85、82、および69%減少しました。 しかし、シュードモナス PGR-11を土壌に接種することによって、以下に示すように(一部のみを示す)、これらすべてのパラメーターが、未接種と比較して大幅に増加しました。

N-GlcNAcが植物成長促進効果を示す

State Key Laboratory of Food Nutrition and Safety, College of Food Science and Engineering, Tianjin University of Science and Technology, Tianjin, Chinaらのグループは、N-GlcNAcが植物の生長促進効果を示すことを報告しています。
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35665438/

キチンは、セルロースに次いで、生物界で2番目に豊富な多糖類です。キチンとキトサンは生分解性で無毒であり、土壌と基質としての品質、植物の成長、植物の回復力を改善し、強化された持続可能な作物生産の開発に大きく貢献するものとして、ますます注目を集めています。キチンとその誘導体の添加は、多くの作物の新鮮収量重量を改善することができます。しかし、植物の成長促進、栽培、および農業環境の持続可能性におけるキチン・キトサンの機能に関する知識は限定的であり、収量の増加、植物防除の予測可能な活性化、収穫貯蔵寿命の延長、更には農産物およびそれらの細菌叢に対する肥料中の栄養素の徐放の改善らに対して更なる貢献を制限してしまっています。
N-アセチル-D-グルコサミン(N-GlcNAc)は、地球上で最も豊富な炭素-窒素バイオ化合物であり、節足動物の外骨格、糸状菌の主成分、および細菌の細胞壁であるキチン、キトサン、ペプチドグリカンのポリマーに含まれる誘導体化グルコースモノマーです。

トマトを対象として、N-GlcNAc自体が植物の成長を促進するという仮説の検証実験が行われました。予想通り、N-GlcNAcで処理された植物は、自然土壌でより高い草丈、より大きな全新鮮重量、およびより大きな茎重量を生み出しました。 N-GlcNAcに曝露された植物の草丈の増加は、1.29倍となり、植物の全体の新鮮重量は、1.33倍となりました。

N-GlcNAcに曝露された根圏土壌サンプルには、比較的豊富なProteobacteria、Actinobacteria、Planctomycetesを含む142の固有のOTUが含まれていました。 N-GlcNAcに曝露された植物の根圏土壌サンプルにおけるProteobacteriaとActinobacteriaの相対的な存在量は、コントロールよりもそれぞれ3.89%と45.82%増加していました。

興味深いことに、Bacillus cereusによって産生されたオーキシンインドール-3-酢酸(IAA)は、N-GlcNAc処理で増加し、LB培地で60 mmol/LのN-GlcNAcと共培養すると92.9mg/Lに達しました。 N-GlcNAcがIAA産生を活性化するこの能力は、P. mirabilisおよびP. putidaの菌株に対しては、外因性基質トリプトファンを供給することで増加しました。トリプトファンの添加はまた、B. cereus and S. thermocarboxydusの菌株におけるIAAの蓄積も促進しました。

このようにして、本研究は、フィールドでの植物生育促進根圏細菌の利点と安定性を理解して利用するための新しい方向性を提供し、微生物シグナル伝達分子として重要なキーとなるN-GlcNAcを明らかにしました。N-GlcNAcは、根圏細菌叢の再構成を促し、根圏細菌叢の代謝の変化を誘発し、それによって植物の成長を促進するのです。

小麦の根圏:トリコデルマを用いて病原菌フサリウムを押さえる

School of Bioengineering, Qilu University of Technology, Jinan, Chinaらのグループは、トリコデルマ アトロビリデ HB2011(Trichoderma atroviride HB20111)の種子への接種が小麦の根圏真菌叢に及ぼす影響について報告しています。
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC9188553/

フサリウム属による小麦の冠腐病と小麦の眼紋病は、小麦の主要な土壌伝染病です。
生物学的防除剤としてのストレプトマイセス、バチルス、シュードモナス、放線菌、トリコデルマなどは、病原性真菌のコロニー形成を減らし、土壌中で抗生物質と有機化合物を生成し、植物の成長を促進することができます。種子ドレッシングは費用効果の高い方法であり、作物の病気の予防と管理に大規模に適用できる可能性があります。生物的防除剤として、トリコデルマの種子ドレッシングは、植物の真菌性疾患を防除するためにますます注目されています。 トリコデルマによって制御される一般的な病原体には、Bipolaris sorokiniana、F. pseudograminearum、F. oxysporum、R. solani、R. cerealis、および他の多くの植物病原体が含まれます。

トリコデルマ処理における総真菌のqPCRによって測定されたコピー数は、コントロールに比べて47.2%減少しました。AscomycotaとOlpidiomycotaは、コントロールと比較して、トリコデルマ種子ドレッシング後の根圏真菌叢で有意に変化し、その中で、Ascomycetesの含有量は54.2%減少し、Olpidiomycotaは54.8%増加していました。トリコデルマ処理は、フサリウムの相対的な存在量を減少させました。Alternaria spp.の相対的な豊富さは、トリコデルマ処理によって、コントロールと比較して3.26%減少しました。これらの減少は、根圏土壌におけるOlpidiumとBotryotrichumの相対的な存在量の顕著な増加を伴っていました。

これらの結果として、フサリウム冠腐病の場合、トリコデルマ処理により病害指数が64.3%減少し、トリコデルマの種子ドレッシングで処理された小麦の収量は、コントロールと比較して、7.7%増加しました。

抗体やレクチンにとって代わる高精度な肝臓がんの診断方法:ターゲット分子の鋳型を使う

State Key Laboratory of Analytical Chemistry for Life Science, School of Chemistry and Chemical Engineering, Nanjing University, Nanjing, Chinaのグループは、AFP-L3をマーカーとして使用し、AFP-L3を鋳型として作られたプローブ(MIP)を用いた肝臓がんの診断方法について報告しています。
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC9020343/

triMIP-PISAと呼ばれる新しい戦略は、糖タンパク質疾患バイオマーカーの糖鎖修飾の変化を検出することにより、より正確な疾患診断を行う技術として開発されました。この方法は、モノクローナル抗体の特性に近い優れたタンパク質認識特性、およびレクチンよりも優れた優れた単糖認識特性を組み合わせています。

この方法は、3つの異なるタイプの鋳型分子プローブを用いた糖タンパク質バイオマーカーの認識とプラズモニック検出を統合しています。
N末端エピトープインプリント基板を使用して臨床サンプルから標的糖タンパク質を特異的に抽出し、次に捕捉された標的分子をラマンレポーター1でカプセル化されたC末端エピトープインプリントナノタグで標識し、糖タンパク質のフコース化糖鎖をレポーター1とは異なる特徴的なラマンピークを持つラマンレポーター2でカプセル化されたフコース(Fuc)インプリントナノタグで標識します。このようにして基板上に形成されたサンドイッチ様免疫複合体を、プラズモニック検出します。

本研究では、この方法を、AFP-L3をマーカーとして使用するHCC診断に適用しています。レポーター1を含むナノタグによって生成されたラマン信号は総AFP量を表し、レポーター2を含むナノタグによって生成されたラマン信号はAFPのフコース化糖鎖(L3とも呼ばれる)の量を示します。このようにして、ヒト血清中のAFPの総量(AFP-L3/AFP)に対するフコース化糖鎖を持つAFPの相対的な発現レベルは、HCC患者の信頼できる特異的な指標をとなります。 AFP N末端エピトープインプリント基板のKd値は、LCAレクチンよりもはるかに小さい10 -9Mレベルに達しています。

血中B型肝炎表面抗原のO-型糖鎖修飾がヌクレオチドアナログを用いた肝炎治療効果の良いマーカーとなる

順天堂大学静岡病院らのグループは、血中のO-型糖鎖修飾を受けたB型肝炎表面抗原(HBsAg)が、従来のイムノアッセイを通じて血清HBVウイルスレベルを評価するために使用でき、特にNA療法を受けている患者におけるウイルス動態の新しい潜在的なバイオマーカーとなる可能性があると報告しています。
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35641912/

現在、ヌクレオシド類似体(NA)の経口投与は、NAの優れたウイルス学的有効性と安全性のため、慢性B型肝炎患者にとって最も一般的な治療戦略です。 NAの長期投与は、ほとんどの患者でHBV増殖を抑制し、線維化や肝硬変の退行を含む生化学的寛解と組織学的改善をもたらします。ただし、肝内共有結合閉環状DNA(cccDNA)が持続するため、HBV感染を完全に排除することはできません。肝内cccDNA濃度を測定することは、増殖能力のある残留ウイルスを評価するための最も直接的な方法です。ただし、肝生検の必要性やcccDNAを定量化するための標準化された方法の欠如などの問題があります。

HBsAgは、HBV感染の診断のための定性的な血清学的マーカーとして長きにわたり重宝されています。定量的HBsAgアッセイは、血清HBsAgレベルが血清HBV DNAレベルおよび肝内cccDNAレベルと相関しており、予後の重要性を示していることを示しています。ただし、現在利用可能なHBsAgアッセイでは、HBVウイルスと非感染性サブウイルス粒子(SVP)を区別できません。最近、M-HBsAgのPreS2ドメインのO-型糖鎖修飾が、糖鎖ベースのイムノアッセイを通じて、遺伝子型C HBVウイルスの明確な特徴を反映するものとして同定され、O-グリコシル化M-HBsAgを特異的に認識する組換え抗体(抗Glyco-PreS2)が開発されました。

著者らは、血中のO-型糖鎖修飾を受けたHBsAgレベルが、従来のイムノアッセイを通じて血清HBVウイルスレベルを評価でき、特にNA療法を受けている患者において、ウイルス動態の新しい潜在的なバイオマーカーとなる可能性があることを発見しました。

パルミトイルエタノールアミド(PEA)がCOVID-19の優れた補助療法になる可能性がある

Retrovirus Center, Department of Translational Research and New Technologies in Medicine and Surgery, University of Pisa, 56100 Pisa, Italyらのグループは、パルミトイルエタノールアミド(PEA)は、COVID-19の現在の治療法、更にはコロナウイルスと同様な感染増殖経路を持つ新規のRNAウイルスに対する有望な補助療法となるでしょうと報告しています。
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35632821/

SARS-CoV-2に対する阻害分子の候補の1つに、N-アシルエタノールアミンファミリーのメンバーの1つであるPEAがあります。PEAは、末梢炎症および肥満細胞の脱顆粒を阻害するだけでなく、ラットおよびマウスにおいて神経保護および抗侵害受容効果を発揮することが分かっています。最近、このPEAの抗炎症作用がアナンダミドと同じ経路をたどらないことが発見されました。PEA誘発性の鎮痛および抗炎症活性は、ペルオキシソーム増殖因子受容体アルファ(PPAR-α)の活性化によって媒介され、PPAR-αは、ミトコンドリアおよびペルオキシソーム内のベータ酸化の活性化、およびミクロソーム内のオメガ酸化の同時刺激による脂肪滴の破壊につながるシグナル伝達カスケードを発動します。細菌およびウイルス感染の予防または治療に対して、PEAの有効性も散見されることから、本研究においては、PEAがSARS-CoV-2の感染増殖を阻害するために使用できるかどうかについて検討が行われています。

PEAの細胞毒性ですが、PEAがHuh-7および293T細胞に100μMもの高濃度でアプライされた場合でも、その毒性は検出されませんでした。Huh7細胞を用いたSARS-CoV-2の感染実験において、1μMの濃度のPEAをSARS-CoV-2と同時にインキュベートした場合には、感染72時間後のqRT-PCRで測定にて、SARS-CoV-2ゲノムの量は約64%減少していました。

PEAの効果が、SARS-CoV-2の2つの主要な変異株(デルタおよびオミクロン)に対して評価されました。10および1μMのPEA前処理Huh-7細胞では、デルタ変異株のウイルスゲノムの数が62.4%および51.2%、オミクロン変異株では、43.4%および77.3%減少することが示されました。興味深いことに、PEAに曝露されたSARS-CoV-2デルタおよびオミクロン変異株においては、10μM PEAで、ウイルスゲノムが最大65%近くの減少を示しました。また、PEAを細胞とウイルスの両方に同時にアプライした場合では、1μMで投与されたPEAは、ウイルスゲノムが大幅に減少し、デルタおよびオミクロン変異株で、それぞれ75.3%および72.5%となりました。

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