アーカイブ: 2022年8月1日

大阪大学微生物病研究所らのグループは、マウスのN-アセチルグルコサミン糖転移酵素-IVa（MGAT4A: GnT-IVa）のC-末端領域にレクチンドメインを発見したと報告しています。
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC9296478/

N‐型糖鎖におけるGlcNAc分岐の生合成は、特定のN-アセチルグルコサミン糖転移酵素（GnT）、GnT-Iから-Vによって触媒されます。

著者らは、N-アセチルグルコサミン糖転移酵素-IVaに存在するレクチンドメインが、3つの短いα-ヘリックスを持つ9つのβ-ストランドで構成されるβ-サンドイッチフォールド構造を形成していることを発見しました。このドメインは、GlcNAcに特異的に結合するレクチンとして機能する細菌CBM32にみられるそれと構造的および機能的に類似しています。

更に、GnT-IVaに存在するこのレクチンドメインは、細胞内の糖タンパク質基質への効率的なN‐型糖鎖の生合成に必要であることが分かりました。

Department of Urology, University of California, San Francisco, USAらのグループは、HIVは、細胞固有の方法で細胞表面のフコースとシアル酸の発現レベルを昂進させ、高レベルのフコースとシアル酸を共発現するメモリーCD4+T細胞はHIV感染に非常に敏感であると報告しています。
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC9255966/

糖鎖修飾の状態が、HIV感染細胞の表面で変化していました。下図に示すように、シアル酸の総量（WGAによって認識され、N-アセチルグルコサミンにも結合する）とα2–3シアル酸（MAL-1によって認識される）の両方が、感染中にHIVによって発現昂進していました。

ここで、未感染 (UI)、前駆体 (PRE)、感染 (INF)

更に、下図に示すように、HIVは高レベルのフコース（AOL認識）とシアル酸（WGA認識）を共発現する扁桃腺およびPBMCからのメモリーCD4+T細胞に優先的に感染することが確認されました。

こここで、感染力はHSA陽性で評価された

Tumour Cell Death and Autophagy Laboratory, Cancer Research UK Beatson Institute, Glasgow, UKらのグループは、脱フコシル化がマクロオートファジーを促進すると報告しています。
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC9245654/

マクロオートファジーは長寿命タンパク質の分解の主要なメカニズムであり、オルガネラを分解する唯一のメカニズムであるため、オートファジーの異常は、神経変性疾患、炎症性疾患、糖尿病、癌などのさまざまな疾患につながる可能性があります。

糖鎖修飾を受けるタンパク質の割合が高いため、マクロオートファジーは、ポリペプチドを分解する酵素だけでなく、糖鎖を分解する酵素にも依存しているに違いないと容易に推測されます。

著者らは、糖鎖の分解、特に脱フコシル化がマクロオートファジーのプロセスに強く関与していることを発見しました。
本研究では、細胞および組織におけるリソソーム糖鎖加水分解酵素FUCA1の発現の喪失がオートファゴソームの蓄積を引き起こすことが示され、FUCA1が基礎オートファジーと刺激オートファジーの両方を調節することを示しています。更には、FUCA1はオートファゴソーム-リソソーム融合（FUCA1の喪失は融合プロセスの失速を引き起こす）とオートファジーのターンオーバー段階（FUCA1の喪失はベースライン条件下でLC3-IIレベルの増加を引き起こすが、プロセスのターンオーバー段階を完全にブロックするわけではない）の両方をサポートする、ことが明らかにされました。飢餓状態では、FUCA1の喪失によりオートファゴソームのクリアランス速度が低下し、マイトファジーの誘導時にミトコンドリアが分解されることがわかったことは注目に値し、これはFUCA1が、複数の状況で効率的なオートファジーフラックスに必要であることを示唆しています。

FUCA1の重要性は、先天性リソソーム蓄積症フコシドーシスにつながる遺伝子の突然変異によって例示されていますね。

Department of Soil Science, University of Maragheh, Maragheh, Iranらのグループは、乾燥草地で育つ野草の根圏から分離されたバイオフィルム形成能力に優れた根圏細菌を用いた小麦の成長促進効果について報告しています。
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC9283637/

水不足は、2050年までに地球の耕作地の50％以上で作物に深刻な問題を引き起こすと予想されています。地球規模の気候変動の進行に伴い、干ばつの期間の深刻さ、頻度、期間はさらに増えると予測されています。従って、水の利用可能性が限られた条件下での植物の生存と成長を改善することは、現代の植物科学において非常に重要な課題であり、効率的な植物生産を実現するための前提条件となっています。

本研究の主な目的は、干ばつ環境下で植物の成長を促進し、栄養素を可溶化することによって植物の栄養をサポートし、植物の成長を促進し、バイオフィルムを形成する細菌を分離することでした。干ばつに強い根圏細菌の多様なコレクションを得るために、イランの東アゼルバイジャンの低水分土壌の自然の草地で成長した5つの野草（イネ科）の根から根圏細菌が分離されました。そして、それら単離された細菌株の成長促進能力を、2つの小麦品種を用いて、ポッド実験が行われました。

at three levels of water availability and without (B0) or with the rhizobacteria strain 16-1 (B1), strain 38-2 (B2) and, strain 54-1 (B3).

乾燥した生態系の野草の根圏から細菌を分離し、複数の植物成長促進特性を持つバイオフィルム形成細菌に優れた根圏細菌をスクリーニングすることにより、小麦の収量改善のための3つの有望な候補株を得ることができました。予想通り、これらの細菌のプラス効果は、中程度および/または重度の干ばつストレス下で明らかであり、東アゼルバイジャン草原の暑く乾燥した気候が干ばつ耐性を持つ植物成長促進細菌の進化を促したことを示唆しています。

Department of Clinical Sciences, Lund University, Jan Waldenströms gata, Malmö, Swedenらのグループは、Galectin-4と肥満の間における興味深い相関性について報告しています。
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC9250274/

肥満（BMI≥30kg/ m2）は、健康上の合併症を引き起こし、平均余命を最大約20年短縮します。これは主に、2型糖尿病、心血管疾患、特定の種類の癌など、多くの非感染性疾患を発症するリスクが大幅に増加しているためです。

Gal-4は、健康な人の胃腸管でほぼ例外なく発現していて、腸の炎症を制御する役割を果たします。腸粘膜での炎症性サイトカインの産生を減少させ、Gal-4ペプチドをノックダウンすると、結腸直腸癌の発癌率が高くなります。これは、Gal-4が炎症性腸疾患と結腸直腸癌の両方の発症の病態生理学において重要な役割を果たしていることを示唆しています。ただし、Gal-4の生理学的役割は多面的であり、さらに、頂端側タンパク質の輸送、脂質ラフトの安定化、腸の創傷治癒、細菌性病原体との免疫反応が含まれます。疫学データはまた、心血管疾患へのGal-4の関与を強く示唆しており、心血管疾患および糖尿病の発症の予測バイオマーカーと見なされる可能性があることを示唆しています。

本研究においては、肥満の入院患者と肥満の非入院患者を比較すると、Gal-4レベルは、完全に調整されたロジスティック回帰モデルにおいて、強く肥満の入院患者と相関していることが分かりました（OR 1.72; CI95％1.16–2.54; p = 0.007）。

面白いですね！？

Department of Cancer Biology and Pharmacology, University of Illinois College of Medicine at Peoria, IL USAらのグループは、Gal-1が神経膠腫幹細胞の成長と代謝の再プログラミングに大きく関わっていることを示しています。
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC9247167/

ガレクチン1（Gal-1）とガレクチン3（Gal-3）は、神経膠腫に関連して良く研究されています。 Gal-1は、細胞表面および細胞外マトリックス上のβ-ガラクトース分子に結合します。過去の多くの研究は、Gal-1の発現が腫瘍（結腸癌、乳癌、肺癌、頭頸部癌、前立腺癌、および神経膠腫）の増殖や浸潤と言った攻撃性の高さと悪性度の進行と相関していることを示しており、Gal-1が癌において重要な役割を果たしていることを示唆しています。

本研究はは、Gal-1が低酸素症の診断マーカーである炭酸脱水酵素IX（CA-IX）によって媒介されるメカニズムを通じて、神経膠腫幹細胞（GSC）代謝において重要な役割を果たしていることを強調しています。 Gal-1はHIF-1αの転写制御下にあり、Gal-1はCA-IXとの物理的結合を介して代謝に影響を及ぼします。Gal-1をサイレンシングすると、CA-IXの発現が減少するため、ワールブルク効果が逆転します。従って、Gal-1/CA-IXシグナル伝達経路を標的とすることは、神経膠腫におけるワールブルク効果を逆転させ、神経膠腫幹細胞誘発性の癌増殖の進行を阻害するための新しい戦略を提供します。

where, GAPHD: Glyceraldehyde 3-phosphate dehydrogenase; NPC: neural progenitor cells

マウスモデルにおいて、Gal-1のサイレンシングが生存率を大きく改善することが示されています。

CUHK Shenzhen Research Institute, No. 10 Yuexing 2nd Road, Nanshan, Shenzhen, Chinaらのグループは、イネのPhosphate Response Regulator 2（PHR2）は、アーバスキュラー菌根菌（AFM）による根のコロニー形成に欠かせないと述べています。 PHR2変異体の場合には、根のコロニー形成は、リン濃度が低い場合大幅に減少しますが、PHR2の発現を増加させると、リン濃度が高い場合での根のコロニー形成を部分的に救済します。
https://www.nature.com/articles/s41467-022-27976-8

植物が十分なリンを得ると、SPX（SYG1/PHO81/XPR1）タンパク質は、PHR2の核への転座、およびPHR2のアーバスキュラー菌根菌関連遺伝子を含むリン飢餓誘導遺伝子のプロモーターへの結合を阻害します。これにより、ストリゴラクトンの産出が少なくなり、Myc-Factors（転写因子群）の認識と真菌の侵入に必要な遺伝子の発現が低下し、共生の発達が妨げられます。

しかし、リンが不足すると、SPXタンパク質は分解され、その結果、PHR2は活性状態を維持することが出来、プロモーターのP1BSエレメントに結合して、根圏の真菌を活性化するためのストリゴラクトンの生合成に関与するCCD7などアーバスキュラー菌根菌にとって重要な遺伝子、アーバスキュラー菌根菌の共生確立やイネブラスト菌への耐性に必要なCERK1、真菌やバクテリアの認識に必要なSYMRK、転写因子NSP2、根のコロニー形成を促進するアポカロテノイドの生合成に関与するZAS、および真菌からのリンの取り込みに必要なアーバスキュラー菌根菌に特異的なリントランスポーター遺伝子PT11（アーバスキュラー菌根周囲の膜に局在する）らを活性化します。その結果、低リン濃度の状態では、根はストリゴラクトンの産生量を増やし、真菌の存在を感知することができ、真菌は根にコロニーを形成するように活性化され、アーバスキュラー菌根周囲の膜に局在する栄養素輸送体を介して植物とアーバスキュラー菌根菌の共生が機能するようになります。
このようにして、アーバスキュラー菌根菌の共生の確立は、PHR2によって調節されるリン飢餓応答の結果として可能になると考えられます。

Arb.: Arbuscules; Ves.: Vesicles; phr2(C): CRISPR-Cas9 generated phr2 mutant

Health Intelligence, Western Cape Government: Health and Wellness, South Africaらのグループは、SARS-CoV-2 オミクロン BA.4/BA.5株の重症度について報告してます。
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC9258293/

BA.4/BA.5に感染した3,793人の患者と以前の流行株の190,836人の患者の間でそのリスクを比較した結果、重度の入院/死亡のリスクはBA.4/BA.5株とBA.1株で類似しており（調整済みハザード比[aHR] 1.12; 95％信頼区間[CI] 0.93; 1.34）、両方のオミクロン株は、以前の株（ベータやデルタ株など）よりも深刻な結果のリスクが低いことが分かりました。