アーカイブ: 2022年6月11日

Retrovirus Center, Department of Translational Research and New Technologies in Medicine and Surgery, University of Pisa, 56100 Pisa, Italyらのグループは、パルミトイルエタノールアミド（PEA）は、COVID-19の現在の治療法、更にはコロナウイルスと同様な感染増殖経路を持つ新規のRNAウイルスに対する有望な補助療法となるでしょうと報告しています。
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35632821/

SARS-CoV-2に対する阻害分子の候補の1つに、N-アシルエタノールアミンファミリーのメンバーの1つであるPEAがあります。PEAは、末梢炎症および肥満細胞の脱顆粒を阻害するだけでなく、ラットおよびマウスにおいて神経保護および抗侵害受容効果を発揮することが分かっています。最近、このPEAの抗炎症作用がアナンダミドと同じ経路をたどらないことが発見されました。PEA誘発性の鎮痛および抗炎症活性は、ペルオキシソーム増殖因子受容体アルファ（PPAR-α）の活性化によって媒介され、PPAR-αは、ミトコンドリアおよびペルオキシソーム内のベータ酸化の活性化、およびミクロソーム内のオメガ酸化の同時刺激による脂肪滴の破壊につながるシグナル伝達カスケードを発動します。細菌およびウイルス感染の予防または治療に対して、PEAの有効性も散見されることから、本研究においては、PEAがSARS-CoV-2の感染増殖を阻害するために使用できるかどうかについて検討が行われています。

PEAの細胞毒性ですが、PEAがHuh-7および293T細胞に100μMもの高濃度でアプライされた場合でも、その毒性は検出されませんでした。Huh7細胞を用いたSARS-CoV-2の感染実験において、1μMの濃度のPEAをSARS-CoV-2と同時にインキュベートした場合には、感染72時間後のqRT-PCRで測定にて、SARS-CoV-2ゲノムの量は約64％減少していました。

PEAの効果が、SARS-CoV-2の2つの主要な変異株（デルタおよびオミクロン）に対して評価されました。10および1μMのPEA前処理Huh-7細胞では、デルタ変異株のウイルスゲノムの数が62.4％および51.2％、オミクロン変異株では、43.4％および77.3％減少することが示されました。興味深いことに、PEAに曝露されたSARS-CoV-2デルタおよびオミクロン変異株においては、10μM PEAで、ウイルスゲノムが最大65％近くの減少を示しました。また、PEAを細胞とウイルスの両方に同時にアプライした場合では、1μMで投与されたPEAは、ウイルスゲノムが大幅に減少し、デルタおよびオミクロン変異株で、それぞれ75.3％および72.5％となりました。

東大新領域創成研究科）統合バイオサイエンス学科、らのグループは、O-GlcNAc修飾タンパク質を高感度で検出するための新規な方法を提案しています。
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC9126400/

セリンまたはスレオニンのO-GlcNAc修飾は、核または細胞質タンパク質でのみ発生します。この修飾は、幾つかの観点から、N-グリコシル化またはO-グリコシル化とは大きく異なります。
（1）O-GlcNAc修飾は、細胞の核または細胞質で発生しますが、一般的な糖鎖修飾は小胞体およびゴルジ装置の内腔で行われます。
（2）O-GlcNAc修飾は、O-GlcNAc糖転移酵素（OGT）およびO-GlcNAcase（OGA）の作用による可逆反応ですが、N-およびO-糖鎖修飾は不可逆的です。
（3）タンパク質上の一般的なN-型およびO-型糖鎖は、多くの種類の糖転移酵素のプロセッシングを受けて順次処理および伸長されます。しかし、O-GlcNAc残基は他の単糖で修飾されることはありません。

本研究においては、特に細胞核におけるタンパク質のO-GlcNAc修飾を検出するために、可溶性β4GalNAc-TAをコードする発現ベクターを、SV40 T抗原 N-末端またはC-末端のからの核局在化シグナル（NLS）で構築し、β4GalNAc糖転移酵素を用いて、GalNAcをO-GlcNAc化タンパク質のGlcNAc残基に転移させてGalNAcβ1-4GlcNAcの二糖を形成させます。次に、Wisteria japonica凝集素（WJA）レクチンをプローブとして使用し、GalNAcβ1-4GlcNAc二糖を検出します。
本方法は、二糖タグ法と名付けられました。

この方法で使用されるGalNAc-GlcNAcとWJAレクチンの間の結合力は、1.4×10 ⁵ M^-1と強いKaを持ち、他のどの方法よりもより高い感度を可能にします。更に、GalNAc-GlcNAc配列を持つ糖鎖は動物細胞ではほとんど発現されないことを強調しておく必要があります。GalNAc-GlcNAc構造は、脳下垂体糖タンパク質ホルモン（ロイトロピン、チロトロピン、フォリトロピン）のN-型糖鎖の非還元末端に見られ、血流からのクリアランスシグナルとして機能します。これらの糖タンパク質ホルモンは脳下垂体にのみ存在し、他の組織や細胞には発現していません。

School of Bioengineering, Qilu University of Technology (Shandong Academy of Sciences), Jinan, 250353, Chinaらのグループは、Burkholderia vietnamiensis B418が線虫管理に効果的な生物学的殺線虫剤になり得ると報告しました。
https://www.nature.com/articles/s41598-022-12472-2

ネコブセンチュウ（Meloidogyne spp.）は、特に温室野菜栽培において、広範囲の作物に寄生する可能性のある非常に多食性の寄生虫です。ネコブセンチュウが侵入すると、植物の根に明らかな結び目や虫こぶを引き起こし、根の正常な構造を破壊し、水と栄養を求めて宿主と競争することで、植物は二次病原体に感染し易くなります。ネコブセンチュウの被害は、世界的に見て年間1,000億ドルを超える経済的損失を引き起こすと推定されており、総作物損失の約12.6％を占めています。

ネコブセンチュウ密度の減少率および防除効果に対する様々な処理の影響は次の通りでした。
すべての処理（Burkholderia vietnamiensis B418接種、化学的殺線虫剤フォスチアゼート、および生物学的殺線虫剤アベルメクチン）は、ネガティブコントロールと比較してネコブセンチュウ密度をある程度減少させました。
最高の減少率と防除効果は、B.vietnamiensis B418接種で見られ、それぞれ74.84％と71.15％でありました。
B418の接種により、フォスチアゼート（38.92％から62.71％）およびアベルメクチン（59.24％から67.87％）の阻害効果が増強されました。 しかし、B418接種単独の場合よりも効果は低下しており、B418とフォスチアゼートおよびアベルメクチンの間には何らかの不整合性があると考えられます。

B418の接種により、バクテリアの16S rRNA配列が9.1％から34.6％に増加し、真菌のITS-2 rRNA配列が7.1％から30.3％に増加していました。このことは、薬剤による病害防除処理効果（9.1％）よりもB418接種の方が多くの変化を根圏細菌叢に引き起こしていることを示しています。。

植物成長に対するPGPR(植物生育促進性根圏細菌)の有益な効果には、生物施肥（主に窒素とリンを含む栄養素の取り込みの促進）や植物刺激（植物成長促進ホルモンの生成）などの直接的なメカニズム、更には間接的なメカニズムとして、植物病原体の有害な効果に拮抗する生物制御剤としての二次代謝物の産生、或いは植物の全身抵抗性を誘発する作用があります。何故、B. vietnamiensis B418の接種がネコブセンチュウの阻害に有効であったのかという理由については定かではないのですが、B418を接種したことによる真菌であるモルティエラの増加は、ネコブセンチュウに対する防除効果と相関していることが分かりました。真菌叢におけるこれらの変動は、B418接種が病原体関連種の阻害および植物に有益な種の増強をもたらした可能性があることを匂わせています。

CK: コントロール; FOST: fosthiazate; AVM: avermectin. (+ /−): B418接種の有無

Department of Hepatobiliary and Pancreatic Surgery, The Affiliated Hospital of Qingdao University, Qingdao, Chinaらのグループは、結腸直腸癌および結腸直腸腺腫に対する新規の血中単糖複合マーカーについて報告しています。
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC9099097/

HPAEC-PAD法を使用して、健常人、結腸直腸癌および結腸直腸腺腫患者の血中2つの遊離単糖（Glc-FおよびMan-F）と6つの加水分解単糖（Fuc-H、GalN-H、GlcN-H、Gal-H、Glc-H、およびMan-H）を測定しました。。
血中の単糖の濃度は、健常人よりも結腸直腸癌および結腸直腸腺腫患者で有意に高くなっていました。具体的には、血中のFuc-H、GalN-H、GlcN-H、Gal-H、Glc-H、およびMan-Hの濃度は、健常者と比較して結腸直腸癌患者で有意に高く、血中のFuc-H、Gal-H、Glc-H、およびMan-Hの濃度は、健常人よりも結腸直腸腺腫患者で有意に高くなっていました。

ロジスティック回帰分析を使用して、上記の結果に基づいて診断モデルが開発されました。 2種類のモデルが開発され、1つはMC1で、もう1つはMC2です。
MC1のロジスティック回帰式は次のとおりです：MC1=-8.18-0.021Fuc-H-0.004 GlcN-H + 0.011 Man-H、ここでFuc-H、GlcN-H、およびMan-Hはμmol/Lで表されます。
MC2のロジスティック回帰式は次のとおりです：MC2=-6.639-0.022Fuc-H + 0.003 Gal-H + 0.003 Man-H、ここでFuc-H、Gal-H、およびMan-Hの単位はμmol/Lです。

MC1は健常人と結腸直腸癌患者を区別するために使用され、MC2は健常人と結腸直腸腺腫患者を区別するために使用されます。 MC2とMC1のAUCは、それぞれ0.8025と0.9403でした。
因みに、健常者と結腸直腸癌患者間の既存マーカーCEAのAUCは0.7384でした。

シスメックスのグループは、IgA腎症の診断マーカーとしての血清WFA+-IgA1の評価結果について報告しています。
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC9104065/

著者らは、IgA1の異常な糖鎖修飾に焦点を当てたWisteria floribunda 凝集素（WFA）レクチンと抗IgA1モノクローナル抗体を使用したIgA腎症（IgAN）を診断するための自動サンドイッチイムノアッセイシステムの評価結果について報告しています。

イムノアッセイのためのWFAの有用性はレクチンマイクロアレイによって調査されました。下図は、健常者（HC）およびIgAN患者におけるマイクロアレイ結果の典型的な画像を示しており、健常者と比較してIgAN患者に由来するIgA1でWFAシグナルが有意に増加していることが確認されました。

残念ながら、結果は診断アッセイの観点からは期待外れのようでした、感度= 66％、特異性= 62％。