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理研）免疫学研究所のグループは、ヒトの風邪のウイルスに特異的なCD8⁺ 特定のT細胞がSARS-CoV-2に対して交差反応を示すことを報告しています。
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC8640030/

最近、ヒト白血球抗原(HLA)の対立遺伝子とCOVID-19の関係が注目されています

著者らは、主要なHLAの1つであるHLA-A*24：02と、SARS-CoV-2に対して交差反応するCD8⁺ T細胞との相互作用を評価しています。in vitroアッセイを使用して、癌に対する既存のCD8⁺ T細胞を検出したり、SARS-CoV-2に対する交差反応性CD8⁺ を有するT細胞を検出することができます。
cited from https://www.jstage.jst.go.jp/article/mhc/23/2/23_115/_pdf/-char/ja

PBMCを選別された6種類のペプチド（Pep#1～Pep#6）の存在下で培養し、21日目にエピトープ特異的なIFN-γ産生CD8⁺ T細胞の頻度を評価しました。SARS-CoV-2 Spike タンパク質から選択されたこれら6種類のペプチドは HLA-A*24：02 に高い親和性で結合すると予想されましたが、これらのうち5つはT細胞応答を誘導せず、 Pep#3（アミノ酸配列＝ QYIKWPWYI 、SARS-CoV-2スパイク位置＝ 1208-1216）-特異的なCD8⁺ T細胞のみが、すべてのSARS-CoV-2に感染していない健康なドナー（UHD）に由来する細胞でIFN-γの産生を誘導しました。興味深いことに、Pep#3は、4種類の季節性コロナウイルス（HCoV）を含む他のコロナウイルスと高い配列相同性を示しています。 Spike タンパク質の6種類のペプチドすべてがHLA-A*24：02に対して高い親和性を示すと予測されましたが、5つのペプチドは他の季節性コロナウイルスと相同ではありませんでした。
これらの結果は、HCoV特異的CD8⁺ T細胞がSARS-CoV-2に対して交差反応している可能性があり、既存のメモリーCD8⁺ T細胞が免疫応答の原因である可能性があることを強く示唆しています。

CD8⁺ T細胞が様々なコロナウイルスに対して複数の応答を示す理由とその根底にあるメカニズムを理解するために、単一のTCRレベルでCD8⁺ T細胞の交差反応性を調べました。 Pep#3で再刺激した後、CD107a⁺ CD8をゲーティングすることにより、Pep#3特異的CD8⁺ T細胞株からCD8⁺ T細胞を単離し、TCRレパートリーの単一細胞分析を実施しました。 Pep#3反応性CD8⁺ T細胞のクローン性を分析するために、合計227のT細胞がスクリーニングされ、5つのUHDと1人の血液悪性腫瘍（HM）患者から44のTCRクローンタイプが同定されました。さらに、そのクローンタイプの中から優勢なTCRタイプに焦点を当て、4つのドナー（3つのUHDと1つのHM）から4つのタイプのTCRαとTCRβのペアを特定しました。クローン化されたTCRの特異性と機能を評価するために、TCRαおよびTCRβ遺伝子をSKW3-CD8AB（ヒトT-ALL）細胞株に形質導入し、それらのペプチド特異的応答を評価しました。興味深いことに、4種類のTCRレパートリーは、エピトープ認識において互いに異なっていました。 UHD2のTCR-T（TCR-T-1）細胞はコロナウイルスに由来するすべてのエピトープによく反応しましたが、UHD8のTCR-T（TCR-T-2）細胞はSARS-CoV-1とSARS-CoV-2にのみ反応しました。

Molecular and Cellular Modeling Group, Heidelberg Institute for Theoretical Studies (HITS), 69118 Heidelberg, Germanyらのグループは、分子動力学シュミレーションを用いて、ヘパリンのSARS-CoV-2感染抑制には、３つの役割があると述べています。
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34929169/

ヘパリンのSARS-CoV-2感染抑制には、以下の３つの働きがあります。

(1) ヘパリンは、両方のコンフォメーション（OPENとCLOSE）でSpikeのS1/S2-ヘパリン結合ドメイン（HBD）に結合し、フューリンの切断を防ぐ、
(2) Close状態のSpikeのOpen化と活性化を妨げる、
(3) RBD-HBDを直接マスキングしながら、RBDの動きを止める。

Department of Plant Pathology, Washington State University, Pullman, WA, USAらのグループは、小麦の遺伝子型とその成長段階が根圏細菌叢の形成に影響し、病原菌R.solani AG-8の土壌抑制効果が大幅に変わることを示しました。
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34925393/

近年、根圏細菌叢は大きな注目を集めており、持続可能な農業システムを強化する為に、これら根圏細菌叢を操作することに焦点を当てた多くの研究が行われています。これに関連して、植物の遺伝子型が様々な農業生態系で特定の結果を誘因する細菌を引き付けるであろうというアイデアから、植物遺伝子型特異的な根圏細菌叢の制御という考え方が着目されています。

この研究では、植木鉢での実験条件下において、6種類の冬小麦遺伝子型（Eltan、Madsen、Hill81、Lewjain、PI561725、PI561727）の根圏細菌叢における変化が評価され、培養日周期の増加とともに、小麦遺伝子型に特異的な変化が根圏細菌叢に現れることが示されました。160日周期で、PI561725とPI561727の微生物叢は、他の遺伝子型の細菌叢と明確に区別されました（下図参照）。

結果として、Burkholderiales OTU、特にPI561727およびPI561725の土壌におけるJanthinobacterium属の存在量の違いは、根の病気の減少と小麦の成長の改善に関連していることが示されました。 Burkholderiales OTUは、病原体R.solani AG-8に対する拮抗作用を持つことが知られています。このような事から、適切な小麦の遺伝子型を使用して根圏細菌叢を制御することで、土壌伝染病を管理するための持続可能なアプローチを提供できる可能性があることが示されました。

Division of HIV/AIDS and Sex-transmitted Virus Vaccines, Institute for Biological Product Control, National Institutes for Food and Drug Control, Beijing, Chinaらのグループは、SARS-CoV-2 オミクロン変異株に対するCOVID-19回復期患者（28名）の血清の中和活性を評価しました。
https://www.tandfonline.com/doi/full/10.1080/22221751.2021.2017757

32個の変異すべてを含むSARS-CoV-2 オミクロン Spike（PV-オミクロン）を発現する新しい疑似型ウイルスを構築し、このPV-オミクロンに対する回復期患者の血清（28名のCOVID-19患者からの回復期血清）の中和活性が測定されました。中和活性のED ₅₀、および参照株D614Gと比較した結果も評価されました（下図参照）。デルタ株に比べるとオミクロン株は、中和活性が5.4倍ほど下がっているようです。

National Institute of Allergy and Infectious Diseases, National Institutes of Health, Bethesda, MD, USAらのグループは、SARS-CoV-2 オミクロン変異株の既存のCD8⁺ T細胞免疫に対する影響を調べています。
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC8669839/

この研究では、52人のCD8 ⁺ T細胞が標的とする以前に同定されたSARS-CoV-2ウイルスのエピトープが、新たな変異株オミクロンで変異しているかどうかを調べています（n = 50 変異）。何故ならば、オミクロン株がどの程度まで既存の獲得免役応答に感受性があるかどうかを見極めることが非常に重要だからです。
T細胞関連の免疫反応は、個々人においても幅広く適応性のある応答であり、個人間のHLAハプロタイプという多様性もあることから、一般的に言って、ウイルスがそう簡単にT細胞免疫から逃れられるものではありません。

本被験集団においては、オミクロン変異体（n = 50）に関連する変異のうち、Spikeタンパク質（T95I）のひとつだけがCD8⁺ T細胞エピトープ（GVYFASTEK）と重複していることがわかりました
オミクロン変異株には、Spikeタンパク質にかなりの数の変異がありますが、この被験集団では、Spikeタンパク質からの1つの低有病率CD8⁺ T細胞エピトープのみがひとつのアミノ酸変化を含んでいました。以前に同定されたSARS-CoV-2に対するT細胞エピトープに関連する他の変異はありませんでした。これらのデータは、既存の抗SARS-CoV-2 CD8⁺ T細胞応答を持つほぼすべての個人がオミクロン変異株を認識するはずであり、SARS-CoV-2はこの時点で広範なT細胞エスケープ変異を得るまでには至っていないということは言えそうです。