理研）免疫学研究所のグループは、ヒトの風邪のウイルスに特異的なCD8+ 特定のT細胞がSARS-CoV-2に対して交差反応を示すことを報告しています。
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC8640030/
最近、ヒト白血球抗原(HLA)の対立遺伝子とCOVID-19の関係が注目されています
著者らは、主要なHLAの1つであるHLA-A*24：02と、SARS-CoV-2に対して交差反応するCD8+ T細胞との相互作用を評価しています。in vitroアッセイを使用して、癌に対する既存のCD8+ T細胞を検出したり、SARS-CoV-2に対する交差反応性CD8+ を有するT細胞を検出することができます。
cited from https://www.jstage.jst.go.jp/article/mhc/23/2/23_115/_pdf/-char/ja
PBMCを選別された6種類のペプチド（Pep#1～Pep#6）の存在下で培養し、21日目にエピトープ特異的なIFN-γ産生CD8+ T細胞の頻度を評価しました。SARS-CoV-2 Spike タンパク質から選択されたこれら6種類のペプチドは HLA-A*24：02 に高い親和性で結合すると予想されましたが、これらのうち5つはT細胞応答を誘導せず、 Pep#3（アミノ酸配列＝ QYIKWPWYI 、SARS-CoV-2スパイク位置＝ 1208-1216）-特異的なCD8+ T細胞のみが、すべてのSARS-CoV-2に感染していない健康なドナー（UHD）に由来する細胞でIFN-γの産生を誘導しました。興味深いことに、Pep#3は、4種類の季節性コロナウイルス（HCoV）を含む他のコロナウイルスと高い配列相同性を示しています。 Spike タンパク質の6種類のペプチドすべてがHLA-A*24：02に対して高い親和性を示すと予測されましたが、5つのペプチドは他の季節性コロナウイルスと相同ではありませんでした。
これらの結果は、HCoV特異的CD8+ T細胞がSARS-CoV-2に対して交差反応している可能性があり、既存のメモリーCD8+ T細胞が免疫応答の原因である可能性があることを強く示唆しています。
CD8+ T細胞が様々なコロナウイルスに対して複数の応答を示す理由とその根底にあるメカニズムを理解するために、単一のTCRレベルでCD8+ T細胞の交差反応性を調べました。 Pep#3で再刺激した後、CD107a+ CD8をゲーティングすることにより、Pep#3特異的CD8+ T細胞株からCD8+ T細胞を単離し、TCRレパートリーの単一細胞分析を実施しました。 Pep#3反応性CD8+ T細胞のクローン性を分析するために、合計227のT細胞がスクリーニングされ、5つのUHDと1人の血液悪性腫瘍（HM）患者から44のTCRクローンタイプが同定されました。さらに、そのクローンタイプの中から優勢なTCRタイプに焦点を当て、4つのドナー（3つのUHDと1つのHM）から4つのタイプのTCRαとTCRβのペアを特定しました。クローン化されたTCRの特異性と機能を評価するために、TCRαおよびTCRβ遺伝子をSKW3-CD8AB（ヒトT-ALL）細胞株に形質導入し、それらのペプチド特異的応答を評価しました。興味深いことに、4種類のTCRレパートリーは、エピトープ認識において互いに異なっていました。 UHD2のTCR-T（TCR-T-1）細胞はコロナウイルスに由来するすべてのエピトープによく反応しましたが、UHD8のTCR-T（TCR-T-2）細胞はSARS-CoV-1とSARS-CoV-2にのみ反応しました。
