胆管癌のバイオマーカーとして癌由来エクソソームのハプトグロブリンの末端フコース修飾が注目される

Department of Life Sciences, Pohang University of Science and Technology (POSTECH), Pohang, Gyeongbuk, Republic of Koreaらのグループは、胆管癌由来エクソソームのハプトグロブリンの末端フコース修飾が胆管癌のバイオマーカーとして有望であると報告しています。
https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fonc.2023.1183442/full

腫瘍の糖鎖修飾の変化は、潜在的な癌のバイオマーカーとして着目されています。多くの研究は、しかしながら、可溶性形態で血液を循環する分泌分子の異常な糖鎖修飾変化を見つけることに焦点を当てています。本研究では、細胞外小胞 (EV) と相関する膜結合成分の末端フコシル化が胆管癌と相関することが示されました。

糖鎖分析により、胆管癌由来のEVには通常のEVよりも多くのα1-3/4フコシル化糖鎖 (末端フコシル化) が含まれていることが明らかになりました。しかし、注目すべきことに、α1-6フコース (コアフコース) はサンプル間で同等でした。結果として、胆管癌由来EVにおけるβ-ハプトグロブリン(β-Hp)のα1-3/4フコシル化は、胆管癌の早期診断や術後の再発予測のバイオマーカーとして有用であることが示されました。そして更に、胆管癌由来のフコシル化EVが腫瘍の進行に寄与していることも示されました。


胆管癌におけるEV-Hpのフコシル化の変化

癌治療のための志賀毒素Bユニット(STxB)を用いたDDSについて

enGenes Biotech GmbH, Muthgasse 11, 1190 Vienna, Austriaらのグループは、志賀毒素Bユニットを用いた癌治療のためのドラッグデリバリーシステム(DDS)について報告しています。
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC10157870/

志賀毒素Bサブユニット (STxB) は、レクチンの一種であり、標的腫瘍細胞上のスフィンゴ糖脂質 (GSL) グロボトリアオシルセラミド (Gb3) に特異的に結合します。モノメチルオーリスタチン E (MMAE) を StxB (STxB-MMAE) に結合させ、その腫瘍細胞殺傷能力を2種類の細胞、ヒト結腸直腸腺癌細胞株 – HT-29 (Gb3+) および LS-174 (Gb3-) を用いて評価しました。STxB-MMAE複合体は、Gb3 陽性腫瘍細胞に結合し、MMAE薬剤の取り込みと放出を誘導することで、治療後72時間で HT-29 腫瘍細胞を94%除去することができたと報告しています。

病原性細菌類の初期付着および凝集を防止するための非殺生物性表面活性多糖類の特徴とは

Institut Pasteur Université Paris Cité, CNRS UMR 6047, Genetics of Biofilms laboratory, Paris, Franceらのグループは、病原性細菌類の初期付着および凝集を防止するための非殺生物性表面活性多糖類について報告しています。
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC10156666/

細菌のバイオフィルムは、広範囲に表面付着して凝集した細菌群を形成し、医療用または工業用の表面で発生すると、人間の活動に悪影響を与えます。抗生物質に対する耐性が高いため、バイオフィルムを根絶することは困難であり、バイオフィルム関連感染の防止は、健康上および経済上の主要な問題となっています。バイオフィルムの形成を防ぐための戦略は、多くの場合、広域スペクトルの抗生物質や重金属などの殺生物剤で表面をコーティングして、細菌の付着の初期段階を阻害することです。これらの殺生物的アプローチは、死んだバクテリアや有機物の破片が急速に蓄積することによって、コーティングされた表面の新しい細菌への阻害活性が低下することが問題です。

本研究では、その組成と構造が知られている31種類のグラム陽性およびグラム陰性細菌の莢膜多糖類のパネルを用いて、その抗バイオフィルム活性が調べられました。それらの中で、大腸菌や黄色ブドウ球菌などの典型的な院内病原菌によるバイオフィルム形成を阻害する9つの新しい非殺生物性多糖類が発見されました。

これらの多糖類の詳細な分析を通じて、多糖類が抗バイオフィルム活性を示すには、その緩い構造(すなわち、多数の多糖類構造内の空隙による大きな透過性)と高密度の負に帯電した静電荷の存在が重要せあることが示されました。。

稲の生長を促進するにはバチルス菌の接種が良い

Department of Microbiology, Himachal Pradesh University, Summerhill, Shimla, Indiaらのグループは、稲の生長を促進する植物成長促進細菌(PGPB)について報告しています。
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC10142854/

本研究は、稲の根圏から多種多様な植物の成長を促進するバチルス菌株を選択することを目的として行われました。種子へのバチルス菌株(Bacillus licheniformis MNNITSR2およびBacillus velezensis MNNITSR18)の単独接種および共接種により、カリウム、リン酸二アンモニウム、尿素などの化学肥料の施肥なしで、稲の大幅な成長増進効果が示されました。具体的には、Bacillus MNNIT SR2の接種は、ポット培養アッセイで未処理のコントロールに比較して、8週間後の稲の新鮮な新芽と根の長さと新芽と根の乾燥重量が有意に増加しました(それぞれ(14.7% と 30.8%)と(53% と 35.6%))。同様の結果が Bacillus velezensis MNNIT SR18の接種でも得られ、8週間後の稲の新芽と根の長さと新芽と根の乾燥重量が有意に増加していました(それぞれ(17% と 20%)と(88.3% と 83.7%))。

これらのバチルス菌株は、以下の植物生長促進活性を示しました。

IAA生産: 根の発根、細胞の拡大、細胞分裂の刺激など、様々な生理学的プロセスを調節し、根の表面積が増加することで植物がより多くの栄養素を吸収できるようになります。
リン酸可溶化: 植物は無機リンのみが利用可能であり、有機リン化合物はまずホスファターゼ酵素によって加水分解される必要があります。
シデロフォア生産: 根圏の鉄をキレートすることで、真菌性病原体の増殖を防ぎます。
抗真菌活性: どちらのバチルス菌株も、Rhizoctonia solaniとFusariun oxysporumの菌糸の成長を阻害することができます。
HCN生産: 植物病原菌の呼吸器系に影響を与え、菌糸の成長を阻害します。
アンモニア生産: 植物の成長と生産性を直接促進します
ACC デアミナーゼ活性: 様々な非生物的ストレス、つまり、塩ストレス、洪水ストレス、重金属ストレスなど、様々な悪環境下で ACCの濃度を低下させることにより、植物の成長に有益な効果をもたらします。
非生物的ストレス耐性活性: 両方のバチルス菌株は耐塩性と干ばつ耐性を示し、それぞれ10 ~ 15% のNaClと 25% のPEG 6000に耐性がありました。

光バイオームセンサー(OBS)の実用化にむけて

エムックが開発を進める光バイオームセンサー(OBS)は、光ファイバーセンサーをベースとし、低価格・簡易・速いをモットーとして工夫を重ねたものであります。
OBSの1号機は、OBSの実証機であり、動作確認を行うことが使命でした。
OBSの2号機では、筐体を堅牢な黒アルマイトで仕上げ、光ファイバーセンサー部を交換可能とすることにより実用性を高めました。その結果、1,000個/mL~2億個/mLという広い測定レンジで細菌(生きたバクテリア)を計測できることを実証することができました。この実証作業は、対象とする細菌種を広げながら今後も行っていきます。
OBSの性能の一端をご紹介

OBSの3号機は、筐体のプラスティック化を進めることで筐体に滑らかな曲線を入れつつ、低価格の実現に駒を進め、商品化に目途を付けるものです。


ピペットホルダーにOBS2号機をセットし、サンプルを測定している様子

κ-カラギーナンとキトサンとのナノ粒子サイズの高分子電解質複合体の抗ウイルス効果

G.B. Elyakov Pacific Institute of Bioorganic Chemistry, Far-Eastern Branch of the Russian Academy of Sciences, Vladivostok, Russiaらのグループは、κ-カラギーナン(κ-CRGs)とキトサン(CH)とのナノ粒子サイズの高分子電解質複合体(PEC)の抗ウイルス効果について報告しています。
https://www.mdpi.com/1660-3397/21/4/238

海洋起源のよく知られた多糖類のひとつは、紅藻の多糖類であるカラギーナン (CRG) です。ヘパラン硫酸を模倣するCRG は、ウイルス表面受容体の正電荷をマスキングしてヘパラン硫酸プロテオグリカンに結合するのを防ぐことにより、ウイルスの侵入を含むウイルス複製の感染初期段階を阻害できる潜在的な抗ウイルス剤であることが知られています。

ナノ粒子の形成は、物理化学的特性を調節し、元の多糖類の活性を高める方法のひとつです。この目的のために、κ-カラギーナン (κ-CRG)を元に、キトサンとのの高分子電解質複合体 (PEC) を製造しました。得られたナノ粒子の平均直径は約150 ~ 200 nmでした。

これらの化合物の抗ウイルス効果を、Vero 細胞における単純ヘルペス ウイルス 1 型 (HSV-1) の細胞変性効果の阻害率によって評価しました。結果として、κ-CRGと比較したPECの抗ヘルペス活性は2倍増加し、CHとの比較では13倍の増加が示されました。これは、PECにおけるκ-CRGの物理化学的特性の変化によるものと考えられました。

タバコの黒色シャンク病にかかわる土壌細菌叢の特徴とバチルス菌による生物的防除の影響

Key Laboratory of Microbial Resources Collection and Preservation, Ministry of Agriculture and Rural Affairs, Institute of Agricultural Resources and Regional Planning, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Beijing, Chinaらのグループは、タバコの黒色シャンク病にかかわる土壌細菌叢の特徴とそのバイオコントロールについて報告しています。
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC10108594/

病害が発生している圃場から得られたタバコ根圏土壌サンプルを病害群(D群)とし、健常なタバコが生育している対照区から得られたタバコ根圏土壌サンプルを健常群(H群)とし、病害を発症している圃場にタバコの苗木を移植した後、Bacillus velezensis S719からなる生物的防除剤で処理された圃場から得られたサンプルを生物的防除群(B群)として定義しました。

これらの圃場におけるDesease indexは、下図のようであり、H群で一番低く、D群で一番高く、バチルス菌の接種は病害の抑制に効果があることがわかります。

細菌分類群の相対的存在量を、網(class)レベルで比較した結果、次のような特徴がありました。
B群では、AlphaproteobacterがASVの27.2%を占め、同じグループの他の網よりも少なくとも2倍多い。
D群では、Actinobacterが豊富で、ASVの13%を占めていましたが、B群とH群の割合はそれぞれ10.6%と9.5%でした。
H群では、SphingobacteriaとCytophagiaが豊富で、それぞれ ASVの6.7%と3.5%を占めていました。

げっ歯類は住血吸虫に対する免疫を持つが、その表面に発現するNー型糖鎖のcore α2-Xylose と core α3-Fucoseが抗原になっている

Department of Biochemistry, Emory University School of Medicine, Atlanta, GA, USAらのグループは、褐色ラットおよびアカゲザルにおける住血吸虫感染に対する防御抗体には、その表面に発現するN-型糖鎖のコアXyl/Fucエピトープに対するIgG応答があり、この疾患に対する糖鎖抗原をベースとするワクチン開発の有用性が期待されると報告しています。
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37081851/

住血吸虫症は、住血吸虫属の寄生による感染によって引き起こされ、世界中で2億人以上の人々に感染し、最大7,000 万人に寿命ロスと健康ロスを引き起こします。これは、マラリアによる影響よりも多いのです。従って、新しいワクチンのターゲットが緊急に必要であると考えられています。多くの種類の哺乳類が住血吸虫の宿主となりえますが、ヒトには慢性的に感染するのに対し、げっ歯類は感染後すぐに住血吸虫を排除できます。

ヒトのN-型糖鎖は通常、α6結合フコースによるGlcNAc-AsnのGlcNAc残基のコア修飾を含んでいます。コアα2-キシロース (CX) およびコアα3-フコース (CF) はヒトには見られませんが、昆虫 (CF)、植物 (CX、CF)、および線虫 (CX、CF) の N-型糖鎖には共通して存在しています。

本研究では、CX/CFに対するウサギ抗HRP抗体(ratαHRP)を含むポリクロナール抗体が、in vitroで補体経路を活性化し、住血吸虫を死滅させることが出来ることが実証されました。

PhoSLがHBV感染を阻害する

大阪大学医学部らのグループは、コアフコース結合型レクチンであるPhoSLがHBV感染を阻害すると報告しています。
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC10105536/

現在の抗HBV 療法には、HBVの複製を競合的に阻害できるヌクレオシドおよびヌクレオチド類似体、および HBV感染に対する宿主の免疫応答を調節し、肝細胞の共有結合閉鎖環状 DNA (cccDNA) の分解を誘導できるペグ化インターフェロンの使用が一般的です。

本研究では、ヒト細胞株HepG2-hNTCP-C4のHBV感染に対するコアフコース結合型レクチンであるPhoSLの効果と、HBV感染におけるPhoSL阻害効果の根底にある分子メカニズムについて考察しています。 PhoSLでの処置は、ヒトHBVe抗原(HBeAg)、cccDNA(下図参照)、HBV DNA、およびHBV RNAらのHBV感染のマーカーのレベルを、ドーズ依存的に、細胞毒性なしで劇的に減少させることが示されました。

この場合に二つの阻害メカニズムが考えられます:(1) PhoSLが宿主細胞のタンパク質ダイナミクスに影響を与える、或いは (2) PhoSLがHBVに直接結合する、ということです。結果として、PhoSLは、EGFのEGFRへの結合をブロックすることによりEGFRの活性化を阻害し、更にPhoSLは、HBV 粒子に直接結合することもわかりました。 PhoSLが結合したHBV 粒子は、宿主細胞に取り込まれ、PhoSLは、取り込まれた後にHBV感染を阻害するようです。

このようにして、PhoSL治療は、新しいHBV療法の開発につながる可能性が示されました。

ウクライナの山岳地方に自生するジュニペルス・エクセルサ(ヒノキ科)の根圏土壌から分離された放線菌からの新規抗生物質の開発

Department of Genetics and Biotechnology, Ivan Franko National University of Lviv, Ukraineらのグループは、ジュニペルス・エクセルサ(ヒノキ科)の根圏土壌から分離された放線菌からの新規抗生物質の開発について報告しています。
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC10031196/

天然物は創薬、特に感染症の治療において重要な役割を果しています。しかし、多剤耐性を持つ病原体の急速な出現と拡散により、細菌感染症の急速な拡大がここ数十年で観察されています。この結果、今日では、これらの抗生物質耐性を持つ病原菌と戦う為に、新しい抗生物質の発見が切望されています。

本研究では、372 の放線菌様株が、ウクライナのクリミア半島の山岳部に自生するジュニペルス・エクセルサの根圏土壌から分離されました。そして、これらの株をスポット接種法でスクリーニングして抗菌活性を評価し、選択した株から得られた二次代謝産物抽出物をLC-MSおよび複製解除分析で分析しました。

その結果、ストレプトマイセス属 Je 1–651 株が、緑膿菌を除く、本研究に用いられたすべての微生物試験培養に対して強い阻害活性を示しました。 DNPM 培地で増殖させたJe 1–651 株の粗抽出物では、スピラマイシンとスタンボマイシンに加えて、既存のデータベースには記載されていない未知の7つのピーク(下図の赤い星)が発見されました。これは、新しい抗生物質の潜在的な可能性を示しており、今後の研究が期待されます。

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