本ブログでは、2020年12月15日、[The 2nd Yan report」を引用する形で、SARS-CoV-2は人工的な産物である可能性が高いとする記事をアップしています。
2021年1月15日、米国務省から、Activity at the Wuhan Institute of Virology、と題するFACT Sheetが公開されました。
https://www.state.gov/fact-sheet-activity-at-the-wuhan-institute-of-virology/
この記事の中において、米国務省は、SARS-CoV-2の起源がWuhan Institute of Virology (WIV)であるという明言は避けているのですが、WIVにおける三つのFACTsを次のように示しています。
新型コロナウイルス（SARS-CoV-2）は、咽頭鼻腔だけでなく、目からも侵入してきます。
Sichuan University, Chengdu, Chinaのグループは、コンタクトレンズにマンノース結合型のレクチンであるGriffithsinをコーティングする方法を提案しています。
レクチンの使い方としては簡単で有効かも知れませんね。
https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fpubh.2020.599757/full
Albert Einstein College of Medicineのグループは、新型コロナウイルス（SARS-CoV-2）のRT-PCRにおけるCt-値と死亡率の間の相関について、後ろ向き試験の統計解析から、その結果を報告しています。
https://journals.plos.org/plosone/article/authors?id=10.1371/journal.pone.0244777
新型コロナウイルスで入院した患者1044名に対する後ろ向き試験の結果です。
RT-PCRのCt-値を4分割して統計分析をしています。
Q1: Ct=<22.9
Q2: 23.0<Ct<27.3
Q3: 27.4<Ct<32.8
Q4: Ct=>32.9
結果として、院内死亡率とCt-値は逆相関していることが示されています。
つまり、Ct-値が低いほど院内死亡率が上昇し、Ct-値が高いほど院内死亡率が減少するようです。
言い換えれば、暴露したウイルス数が多ければ、あるいはまた体内でのウイルス増殖が多ければ、死亡率があがるということになります。
Fudan Univ.のグループは、FDA承認の医薬品である低分子化合物（Protoporphyrin IX (PpIX), Verteporfin）が効果的に新型コロナウイルス（SARS-CoV-2）の感染を押さえることをin vitroではありますが示しました。
これら化合物がACE2に結合し、SARS-CoV-2のACE2への結合を阻害するからです。
in vivoでの臨床試験が期待されます。
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2095927320307283?via%3Dihub
抗寄生虫薬であるイベルメクチンが、抗ウイルス作用を持つことが分かっています。その作用機序については、インポーチンらの核輸送タンパク質を阻害することで、ウイルスタンパク質の核内への輸送が阻止されるからだと考えられています。
イベルメクチンそのものには毒性があり、EC50は、1～10mMであります。イベルメクチンを体内に150ug/kgのドーズで投与した場合の血中濃度は9～75ng/mLにしかすぎず、イベルメクチンの薬効を発揮させるには濃度が低すぎます。
そこで、下記のグループは、イベルメクチン（IVM）を内包するナノ粒子（NPs）を用い、経口投与での腸内での吸収率を上げる為、ナノ粒子にFcを融合させることで、腸上皮細胞に発現しているFcRn受容体を介した腸吸収を可能にした治療薬（経口投与可能なFc-融合イベルメクチン含有ナノ粒子：T-Fc-IVM-NPs）の効果を検証しました。
https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acsptsci.0c00179
現段階では、新型コロナウイルス（SARS-CoV-2）を感染させたHEK293を用いたin vitroでの実験ではありますが、T-Fc-IVM-NPsを投与することで、ACE2の発現およびS-タンパク質の発現が抑えられたとのことです。また、この方法は他のウイルスに対しても効果が期待できるとしています。
良いですね。
新型コロナウイルス（COVID-19）対策でも用いられるN95マスクですが、その再使用において、
下記の処理は進められないとのことです。
気を付けましょう。
https://www.hindawi.com/journals/cjidmm/2020/8869472/
La Paz University Hospital, Spainのグループは、新型コロナウイルス（COVID-19）の症状は、SARS-CoV-2のタンパク質カクテルで完全に模倣できるとし、それを踏まえて治療法を提案しています。
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33283062/
新型コロナウイルスの患者においては、COVID-19の初期においては、炎症とサイトカインストームが誘発され、IL-1β, IL-6, TNF-αらが高発現していることが知られています。この段階は、単球やマクロファージの過剰な活性化で説明できます。COVID-19の後期においては、適応免疫が主役に躍り出てきますし、重度の患者では、リンパ球が非常に減少していることが特徴です。
健常者から取得した血球を、SARS-CoV-2のS-タンパク質、N-タンパク質及びP-タンパク質のカクテルでインキュベートすると、COVID-19の状態を模倣した表現型を作ることができます。例えば、単球においては、抗原提示のシグナルパスであるHLA-DRが減少し、免疫チェックポイントのリガンドであるPD-L1が高発現します。
これらのことから、免疫チェックポイント分子に対する阻害剤（抗体）を用いることが有効な治療につながるのではないか？と示唆され、実際にcamrelizumab (PD-1抗体)を用いた治験が開始されているようです。
進展を期待しましょう。
新型コロナウイルスの感染有無の検査には、RT-PCRがGold Standardとなっています。サンプルを鼻腔らより綿棒で取得し、前処理で核酸を抽出してからRT-PCRを実施するのですが、世界的な検査数の増加で試薬や消耗品が不足してきています。
この前処理工程を簡素化できないか、について研究した報告例があります。
https://journals.plos.org/plosone/article/authors?id=10.1371/journal.pone.0243266
結果として、20uL～40uLのサンプルを95℃～98℃にて、2～20分加熱処理するだけで、RT-PCRの良好な結果を得ることができたとのことです。
使用されたRT-PCRキットは、
ABI TaqMan fast Virus 1-Step RT-qPCR kit
Meridian Bioscience Fast 1-Step RT-qPCR kit
です。
但し、UTM Viral Transport COPANを使用してサンプルを回収した場合には、この方法では結果が出なかったということです。
試薬の組成が開示されていないこともあり原因は不明ですが、RT-PCR Kitに使われている試薬の組み合わせによっては、熱処理のみという簡略化前処理は使えない場合があるようです。
ディスポーザブルな新型コロナウイルス（COVID-19）用qPCRチップの試作例が、Imperial College Londonのグループから報告されています。もちろん、このチップは、他の感染症にも使えます。
https://www.nature.com/articles/s41467-020-19911-6
チップは、非常に簡単な構造で、Si基板の上に作り込まれています（チップのサイズは1cm角程度）。Si 4インチ基板で作成した場合のコストですが、約40円／チップということなので、確かにディスポーザブル可能でしょう。
チップの温調はSiに電流を流すことで行われ、検出はmethylene blue（MB)を酸化還元材として使用し電気化学的に行い、MBはDNAのインターカレーターにもなるので、DNAが増幅されると電流が変化することを利用しています。
自分もこの新型コロナウイルス（COVID-19）の重症化機構の解明とその治療薬開発に参画しています。
糖鎖とレクチンに関する経験や知恵を駆使して、研究開発を推進します。本活動に、宜しくご支援お願い申し上げます。
https://readyfor.jp/projects/glycotechnica_covid19research/announcements/150515