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Amsterdam UMCらのグループは、膵管腺癌で発生する異常な糖鎖修飾、とりわけシアル酸修飾に着目し、膵管腺癌の免疫反応の抑制メカニズムについて研究しています。
https://www.nature.com/articles/s41467-021-21550-4.pdf

膵管腺癌の周辺には、線維性間質細胞と免疫反応抑制的な骨髄系細胞群（樹状細胞、マクロファージなど）が存在しています（TMEと呼ばれる）。膵管腺癌で発生する糖鎖修飾異常については、Syalyl LewisA, Sialyl LewisX, O型糖鎖の刈込、多分岐N型糖鎖とフコース修飾らの発現が上昇し、癌の増殖や浸潤と相関関係があることは既に指摘されています。しかしながら、これらの糖鎖修飾の変化と免疫細胞とのリンクについては不明な点が多々残っています。
著者らは、癌でしばしばみられるα2-3 Sia修飾の高発現に着目し、免疫細胞群とのリンク、および膵管腺癌の病態との関係性を深堀しています。TMAを構成する骨髄系細胞群の構成は、健常組織と膵管腺癌では大きく異なっており、膵管腺癌では、単球由来マクロファージ (moMac), 単球由来樹状細胞 (moDC)が大半を占めています。しかも、moMacがmoDCに比べて増加すると膵管腺癌の生存率が低下し、他の骨髄系細胞群は生存率と相関を示さないことが分かりました。
高発現したα2-3Siaは、骨髄系細胞群に発現しているSiglec-7, Siglec-9と結合し、CD206の発現上昇とともに、単球のmoMacへの分化を促進することが示されました。更に、この変化は、免疫抑制的に機能する免疫チェックポイント分子であるPD-L1の発現上昇や免疫抑制的なサイトカイン（IL-10）の分泌を促すことも示されました。

University of California, San Franciscoらのグループは、2020年11月から2021年1月にかけて、サンフランシスコ・ベイエリアでの新型コロナウイルス（SARS-CoV-2）の変異状況をアップしています。
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7941666/

ベイエリアでは、B.1.427、B.1.429変異株が多いようです。下図を参照してください（L452R, S13I, W152Cが主な変異となっているようです）。なお、これら変異株の特性の違いについては、今後の課題です。

名古屋大学らのグループは、Siglec-7のカウンター受容体を同定したようです。
https://www.jbc.org/article/S0021-9258(21)00251-9/fulltext

Siglec-7はシアル酸を認識し、主にナチュラルキラー(NK)細胞上に発現しており、癌細胞上のリガンドに反応すると免疫抑制的に作用することが知られていました。しかし、Siglec-7の受容体には完全には同定されていませんでした。著者らは、K562細胞からFc-融合Siglec-7、diSia-dextran polymerを用いて受容体を精製し、MSによりSiglec-7のカウンター受容体がleukosialin (CD43) であることを確認しました。さらに、K562細胞に対するNK細胞の細胞毒性は、シグレック-7依存的にleukosialinの過剰発現によって抑制されることを示しました。

Harvard Univ.とEmory Univ.のグループは、ABO(H)血液型とSARS-CoV-2の相互作用について報告しています。
https://ashpublications.org/bloodadvances/article/5/5/1305/475250/The-SARS-CoV-2-receptor-binding-domain

SARS-CoV-2のNTDには、ガレクチン様構造が存在することから、ABO(H)血液型抗原に結合する可能性があることが示唆されていました。著者らは、糖鎖アレイを用いて検証した結果、呼吸器系の上皮細胞に発現するA血液型TypeI（血液型A抗原TypeI）に結合することを確認しました。

University of Ferraraらのグループは、新型コロナウイルス（COVID-19）にて急性呼吸不全（ARDS）を発症しICU治療を受けざるを得なくなった患者と、その他従来のARDS患者との間におけるマーカーの違いを報告しています。
https://ccforum.biomedcentral.com/articles/10.1186/s13054-021-03499-4

終末糖化産物受容体（RAGE）、Angiopoietin-2 (Ang-2)、可溶性intercellular adhesion molecule-1 (ICAM-1)、可溶性vascular cell adhesion molecule-1 (VCAM-1)、E-Selectin、P-Selectinが比較されています。

アンジオポエチンは、脈管形成あるいは血管新生を促進する糖タンパク質であり成長因子、
ICAM-1は、免疫系の細胞間相互作用を司る接着分子の一つであり、活性化リンパ球の血管内皮細胞への結合に関与、
VCAM-1は、血管内皮細胞上に発現する接着部分子であるが、未刺激の血管内皮細胞上に殆ど存在せず、IL-1やTNFのような炎症性サイトカインの刺激によって初めて誘導される、
E-Selectinは、血管内皮のリンパ球接着分子、
P-Selectinは、血管内皮および血小板表面のリンパ球接着分子、であります。

COVID-19では、RAGEはほとんど関係しておらず、ARDSがウイルス感染由来であることを示します。COVID-19では、Ang-2, ICAM-1, BVCAM-1, E-Selectinらが上昇（P-Selectinは逆に減少）することから、COVID-19のICU患者では、血管内皮が大きなダメージを受けていることが示唆されます。

2021年2月19日のブログにて、Q677H, Q677Pという変異が昨年末から北米で上昇していることを紹介しています。

Univ. of Bernらのグループは、Q677変異がSARS-CoV-2感染に与える影響について、SWISS MODELを使って議論しています。
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7885944/

S1/S2切断部位には多塩基切断部位（RRAR Motif）が存在します。位置677は多塩基部位（furin binding pocket）の外側にありますが、この部位にプロリンが存在すると、 S1/S2接合部での切断に有利に働く構造変化を引き起こす可能性があります。この切断は、フューリン様活性だけでなく、トリプシン様プロテアーゼ（TMPRSS2など）およびカテプシンによっても支配されます。さらに、プロリンの導入は、S689の炭素骨格から3.7オングストローム離れているように見えます（ネイティブグルタミンの4.9オングストロームと比較して）。これは、タンパク質分解切断に有利なコンフォメーションを促進する原子相互作用を促進する可能性があります。S：Q677H置換の場合、ヒスチジンのプロトン化は、プロテアーゼへのアクセス可能性に影響を与えるコンフォメーションスイッチとして同様に機能する可能性があります。これらの構造変化は、より効率的なウイルス侵入を促進する可能性があります。

新型コロナウイルスに感染した場合、無症状から重症まで幅広い病態が存在します（COVID-19）。無症状者と重症患者ではどのように免疫反応が異なっているのか？この問題については、数多くの研究が行われていますが、Third Military Medical University, Chongqing, Chinaらのグループの研究は、かなりクリヤに液性免疫と細胞性免疫に大きな違いがあることを示しています。
https://www.nature.com/articles/s41392-021-00525-3

病態を無症状／軽症、中症／重症に分けた場合に、無症状／軽症の場合には、SARS-CoV-2特異的なIgGの産生が少なく、胚中心も形成されないため、SARS-CoV-2特異的なB細胞の活動は過渡的な形で終わってしまいます。それに対して、中症／重症の場合には、SARS-CoV-2特異的なIgGは如実に増加しており、胚中心が活動していることを表すcirculating cT_FH細胞やケモカインであるCXCL13が有意に上昇しており、液性免疫が反応が強く表れていることを示します。
一方、無症状／軽症の場合には、IFN-γを産生するCD8+ T細胞、SARS-CoV-2特異的なT_H1細胞、Granzyme B（GZMB）が高発現しており、細胞性免疫が非常に活発であることを示します。（なお、Granzyme B（GZMB）は，活性化した細胞傷害性Ｔ細胞とNK細胞の細胞質顆粒に存在するセリン・プロテアーゼであり、標的細胞のアポトーシスを誘導します。）

つまり、無症状／軽症の場合は、細胞障害性T細胞や、ここでは論述されていませんがNK細胞らがSARS-CoV-2の感染を抑え込んでいるが故の状態と考えられ、このプロセスでウイルスを抑え込めなくなると液性免疫が前面に出てくるという考え方が成り立ちそうです。あるいは、液性免疫と細胞性免疫のバランスの結果と言ってよいのかも知れません。
また、最近は季節性の風邪の原因となるコロナウイルスに対する抗体のSARS-CoV-2との交差反応も着目されており、無症状／軽症に関係している可能性があるということが指摘されていますが、更なる検証が必要ですとしています。

Columbia Universityのグループは、新しいSARS-CoV-2の変異株（B.1.526）がNew Yorkで出現したと報告しています。B.1.1.7、B.1.351、およびP.2らとの遺伝子変異の違いは下図に示されています。
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7924303/