Harvard Medical Schoolのグループは、膵管腺癌のバイオマーカーとして、そのオルガノイドを用いた研究から候補となるバイオマーカーを報告しています。
https://insight.jci.org/articles/view/135544
(1) 糖鎖の観点から：High mannoseおよびLewis Xエピトープ構造が膵管腺癌で増加する。
(2) 細胞外小胞（EV）タンパク質の観点から：ANXA11（アネキシンA11：小胞体の輸送小胞COPIIの出芽領域に動員されるカルシウム依存性リン脂質結合タンパク質）が増加する。
更なる研究の進展を期待しましょう。
新型コロナウイルス（SARS-CoV-2）において、現在は、Sタンパク質のD614G変異を持つ株が感染の主流となっています。University of Massachusetts Medical Schoolらのグループは、何故、過去のD614よりもD614G変異の方が感染能が高いのかという原因についてその研究成果を報告しています。
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7492024/
SPRを用いて、D614GとACE2との相互作用を解析した結果は、D614G変異によってACE2へのアフィニティーが高まっていることが原因ではないことを示しており（むしろ、若干アフィニティーが下がっている）、Cryo-EMによるSタンパク質の構造解析からは、RBD（Receptor Binding Domain）のClose とOpenの存在割合が変化しており、D614よりもD614G変異の方がOpen構造の割合が増加していることを示しています。従って、D614Gの感染能が高まっている原因は、Sタンパク質のRBDがより露出したことが原因であると結論されています。
新型コロナウイルス（COVID-19）の診断として胸部のレントゲンやCTが常用されます。Univ. of Oklahomaのグループは、胸部のX線撮影画像からCOVID-19由来の肺炎かどうかを判別するに際し、Deep Learningの手法を取り入れることで、その診断精度を上げることに成功しています。
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S138650562030959X?via%3Dihub
Deep Learningは、Convolutional Neural Networkを6層使用し、入力する胸部X線撮影画像を224 x 224 x 3のサイズとし、Convolutionは3 x 3としています。入力画像の x3はR, G, Bの3色であることを示します。X線撮影画像は、白黒のグレーですので、R, G, Bの3色は、下図に示すような画像の前処理で作っています。下図において、(Ip)は横隔膜を除去した画像、 (Ieq)は画像の強度ヒストグラムを用いてコントラストを調整する画像処理方法を加えたもの、そして (Ib)は、更にバイラテラルフィルタを加えたものであり、この３つの (Ip), (Ib), (Ieq) を用いてR, G, B画像をシミュレートしています。
Deep Learningの結果は、
X線撮影画像をそのまま用いたsimple modelで、精度として88％が得られ、上記した画像の前処理を加えると精度は94.5％に向上したとのことです。
Deep Learningを用いた診断が益々医療の現場で用いられる時代になるのではないでしょうか？
ウイルス感染において、NK細胞は重要な役割を果たしています。University of Ferraraのグループは、新型コロナウイルス（SARS-CoV-2）の感染において、NK細胞が如何なる振る舞いをしているかについて研究した結果をもとに、抗-NKG2A抗体を用いた治療法を提案しています。
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32859121/
新型コロナウイルスのSタンパク質（Spike 1 Protein, Spike 2 Proteinそれぞれ）を肺上皮細胞に感染させ、NK細胞と共培養することによって、GATA3（転写因子）、HLA-E（ヒト白血球抗原のEクラス）、NKG2A/CD94（NK細胞抑制性受容体）、CD107a（脱顆粒マーカー：細胞障害因子の放出）、そしてIFN-γの発現状態を調べました。その結果、下記のような発現変動が起こっていることが分かりました。
これらの変化は、Sタンパク質のSP1（Spike 1 Protein）によって引き起こされています。SP1の感染によって、転写因子であるGATA3が活性化され、SP1ペプチド（8mer）がHLA-Eによって細胞表面に提示されます。HLA-EとNKG2A/CD94が結合することにより、NK細胞に抑制性の信号が入ります。同時に細胞障害因子の放出も抑制され、IFN-γの放出も抑制され、ウイルス排除の免疫機能が弱まっていることが示されています。
従って、結論として、感染初期において、抗-NKG2A抗体（monalizumab）を投与することが免疫活性を増強する手段として有効ではないか？としています。
新型コロナウイルスの第二波が襲ってきています。昨日は東京の新規感染者数は472人に達したとのこと。大阪＝195人、愛知＝181人、福岡＝121人、大都市は何処も100人越えです。
7月19日のエムックのHomepageをアップしたのですが、本日、emukk.comやエムックで検索結果が出るようになりました。検索エンジンにインデックスされたようです。10日間でインデックスされたようで、割と早かったですね。
これからは、コンテンツを充実させながら、キーワードの検索順位のアップを行います。
7月19日にこのHomepageを立ち上げて以来、未だにemukk.comでは検索されません。Google Search Consoleへは、Websiteを登録できましたので、気長に待つしかなさそうです。検索エンジンにインデックスされるには、一か月はかかるという情報があるので、まだまだかと思いますが、何日かかるか？この際ですから確認してみましょう。
WordPressのテーマですが、このHomepageを立ち上げた当初のTwenty SeventeenからSydneyに変更してみました。
どちらも良いテーマだと思います。
2020年7月19日、Homepageを開設しました。現在工事中です。ご迷惑をお掛けしますが、もうしばらく御辛抱お願い致します。
