SARS-CoV-2の変異株(B.1.617.1 = カッパー株、B.1.617.2 =デルタ株)に対するファイザーとアストラゼネカのワクチンの効果について

University of Oxford, Oxford, UKらのグループは、SARS-CoV-2の変異株(B.1.617.1 = カッパー株、B.1.617.2 =デルタ株)に対するファイザーとアストラゼネカのワクチンの効果について述べています。
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC8218332/

カッパー株 = B.1.617.1 は、RBDにおける二つの変異(L452R と E484Q)によって特徴付けられ、デルタ株 = B.1.617.2 は、RBDにおけつ二つの変異(L452R と T478K)によって特徴付けられます。L452Rという変異は、これら二つに共通です。

著者らは、BNT162b2 Pfizer-BioNTech あるいは ChAdOx1 nCoV-19 Oxford-AstraZenecaのワクチンを接種したヒトの血清の B.1.617.1 や B.1.617.2 に対する中和活性を評価しました。

B.1.617.1 に対する幾何平均の中和活性は、Pfizer-BioNTechの場合で、Victoria株と比較して 2.7-倍減少し(p < 0.0001)、Oxford-AstraZenecaの場合は、2.6-倍減少しました(p < 0.0001)。Victoria株とは、武漢ウイルス系統であり、オーストラリアでアイソレートした株です。

B.1.617.2 に対する幾何平均の中和活性は、Pfizer-BioNTechの場合で、Victoria株と比較して 2.5-倍減少し(p < 0.0001)、Oxford-AstraZenecaの場合は、4.3-倍減少しました(p < 0.0001)。

Oxford-AstraZeneca や Pfizer-BioNTechのワクチンで得られる中和活性はこのように減少していますが、これらの変異株がワクチンで得られる中和活性を完全に亡き者にしてしまうというエビデンスはありませんので、その点には注意しましょう。

COVID-19を発症するとスフィンゴシンが減少する

Medical University of South Carolina, Charleston, USAらのグループは、血中のスフィンゴシンの減少が、COVID-19の無症状患者とそうでないヒトを早期に見分けるための高感度で特異的なマーカーになり得ると報告しています。
https://www.nature.com/articles/s41598-021-93857-7

抗体が陽性 (n = 134) と陰性 (n = 130)の比較において、スフィンゴシンのレベルが陽性者で少しですが有意に(p < 0.05)上昇していました(陽性者=28.96 vs. 陰性者=23.25 pmol/5 × 10−5 L serum)。 そして更に、COVID-19 患者においては、血中のスフィンゴシンのレベルが無症状者に比較して、15倍ほど減少していました(無症状者=28.96、COVID-19患者=1.88 pmol/5 × 10−5 L serum)。下図においては、Sphingosine (Sph)、dihydro-sphingosine (dhSph)、sphingosine 1-phosphate (Sph-1p)と略されている。

ROC解析の結果は、スフィンゴシンの閾値を 8.2 pmol/5 × 10−5 L と設定した場合に、感度 = 98.47%(95% CI 94.60–99.73%)、特異度 = 98.51%(95% CI 94.72–99.73%)が得られ、SARS-CoV-2抗体は陽性ではあるものの無症状な人とCOVID-19患者を見分けるに高感度で特異度の高いマーカーであることが分かりました。 しかしながら、スフィンゴシンとdihydro-スフィンゴシンは、重症度の見分けはできませんでした。

生化学的なバイオマーカーである lactate dehydrogenase(LDH)のレベルが、COVID-19患者の重症者で上昇しているという事が知られています。ここで発見されたスフィンゴシンのレベルの減少は重症度と相関していませんが、これらを合わせると、スフィンゴシンのレベルが高いとCOVID-19の症状を抑えることが出来、スフィンゴシンのレベルが減少すると炎症が助長される場合があると言えそうです。

SARS-CoV-2 S2のエピトープがコロナウイルスに対する交差中和抗体を誘発できる免疫原の青写真となりうる

Fred Hutchinson Cancer Research Center, Seattle, USAらのグループは、SARS-CoV-2 S2 に存在するエピトープが、コロナウイルスに対する交差中和抗体を誘発できる免疫原になり得ると報告しています。
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34237283/

4名のCOVID-19回復期患者から得た198種類の抗体から、14種の中和抗体を精製しました。その内、1つはNTDをターゲット、1つはS2のエピトープを認識し、11種はRBDに結合しました。それらの IC50は、 0.007 μg/ml から 15.1 μg/mlに分布していました。

S2 サブユニットには、少なくとも1つのエピトープが、免疫原性は弱いものの、5つのヒトコロナウイルスの4つに存在しています(SARS-CoV-1、SARS-CoV-2、OC43、HKU1)。そのようなエピトープは、有望な交差抗体として見つかったCV3-25に認識されており、コロナウイルスに対する広範囲な中和抗体を開発する場合の貴重な免疫原になり得ると結論されました。因みに、CV3-25のSARS-CoV-2に対するIC50は、0.34 μg/mlでありました。

Mannose特異的なレクチンを用いてSARS-CoV-2をブロックする:SARS-CoV-2にはマメ科レクチンが適する

Université Paul Sabatier, Toulouse, Franceらのグループは、SARS-CoV-2、SARS-CoV、MARS-Covに対して抗ウイルス効果を示すmannose特異的なレクチンについて議論しています。
https://www.mdpi.com/2073-4409/10/7/1619/htm

植物、菌類、藻類、バクテリアなどから抽出されたMannose特異的なレクチンは、HIV-1、HPV、herpes、HCV、Ebolaウイルスらに抗ウイルス効果を示すとういう観点から多くの研究があります。このような例として、藻類レクチンのgriffithsin、シアノバクテリア由来レクチンであるcyanovirinやmicrovirin、放線菌由来のactinohivin、各種GNA-関連のレクチン(NPA や ASAなど)に関する論文が多く存在します。多くのMannose特異的なレクチンは、ウイルスの増殖を、少なくともin vitro実験下では、阻止しますが、ウイルスエンベロープに存在するMannose型のN-型糖鎖に干渉する能力に依存しています。

SARS-CoV、MERS-CoV、SARS-CoV-2らのSpikeを修飾するN-型糖鎖は、high-mannoseのみでなく、しばしばシアル酸修飾を伴う複合型がメジャーである場合もあります。コロナウイルス毎にこれら糖鎖の分布には違いが存在しており、Spikeのシールディングに多様性が見られます。


図の説明: ほとんどが複合型である場合 (赤), ほとんどがhigh-mannose (緑), ほとんどがハイブリッド (マゼンタ)。これらの混合であってハイブリッドが少ない場合 (ピンク)、混合でhigh-mannoseがメジャーな場合 (薄緑)、混合でハイブリッドがメジャーな場合 (オレンジ)。SARS-CoV-2の場合には、high-mannose は基本的に3分岐であり、GlcNAc2-Man5–9の構造となっているが、その中でもメジャーな構造はGlcNAc2Man5となっている。

植物、菌類、藻類、バクテリアなどから抽出されたMannose特異的なレクチンは、それぞれに糖鎖結合性はすこしづつ異なるが故に、結果として、各種のコロナウイルスを特異的に認識するようなプローブ・パネルを形成することが可能であります。このような観点から、MERS-CoVに対しては、GNA-関連のレクチンや藻類やシアノバクテリア由来のレクチンが適しており、SARS-CoVやSARS-CoV-2に対しては、trimannoside Manα1,3Manα1,6Man coreに特異性を持つマメ科レクチンが適しています。

Pfizer mRNA ワクチンを二回接種で作られるSARS-CoC-2のRBD, NTD, S2をエピトープとする抗体の特徴について;変異株に対する影響は少ない

Icahn School of Medicine at Mount Sinai, New York, USAらのグループは、Pfizer mRNA ワクチン接種後にできるSARS-CoV-2に対する抗体の特性を報告しています。
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC8185186/

ワクチンを二回接種後、一週間ほどでピークを迎え、その後は徐々に減少していきます。興味深いのは、β-コロナウイルス OC43 や HKU1に対する抗体力価がワクチン接種後にブーストされたということでしょう。

mRNAワクチンによって誘起される抗体の主要なエピトープは、RBD と NTD であり、その他の大半はS2をエピトープとしていました。 SARS-CoV-2のUSA-WA1/2020 株を用いて、これら抗体の中和活性を測定した結果は、一部の抗体のみが中和活性を示すようです(下図参照、3名の試験者から: V1、V5、V6)。

更に、6人の試験者から得た血清に対して、変異株に対する抗体力価が評価されました。どの変異株に対しても抗体力価の低下は、せいぜい2倍程度に収まっています(E406Q、N440K、E484K、F490K)(下図参照、6名の試験者から:V1-V6).
この結果は、Pfizer mRNA ワクチンが多くのSARS-CoV-2変異株に対して有効であることを示唆するものであり、GOODニュースですね。

ロサルタン(高血圧の治療に使用されるACE2受容体拮抗薬)、第二相治験で効果を認めず治験を終了する

University of Minnesotaらのグループは、SARS-CoV-2の治療薬としてのACE2阻害剤であるロサルタンの第二相治験結果からロサルタンに治療効果はないとする結論を出しました。
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC8225661/

この治験は、米国、ミネアポリスにおいて、昨年4月から11月にかけて行われたCOVID-19の治療を目的とするダブルブラインド・プラセボ治験を3か所で行ったものです。

試験介入は、ロサルタン 25mgであり、プラセボも同様です。 eGFR >60 mL/min/1.73 m2の対象者については、日に二回ロサルタンを10日間に渡って服用してもらい、eGFR 30–60 mL/min/1.73 m2の対象者については、日に一回の服用としています。ACE2阻害に対するスレッショールドは、日に20mgとされており、体内での半減期が6~9時間であることから、日に1回よりは2回の方が効果があるとされています。このドーズについては、FDAの最大ドーズ量と安全性の観点から日に50mgが最大とされており、その基準に従っています。このドーズでは、ACE2に対して37%の阻害効果があるとされています。

結果として、しかしながら、治療効果は何も認められず、ウイルス量もどの時点で測定しても差異は認められず、治験は終了しました。

Fcγ受容体を介したエフェクター効果と抗体依存性感染増強 (ADE):SARS-CoV-2の治療用抗体に関して

Biological Defense Program, DSO National Laboratories, Singaporeらのグループは、SARS-CoV-2中和抗体のFcを介したエフェクター機能について研究しています。
https://journals.plos.org/plosone/article?id=10.1371/journal.pone.0253487

抗体依存性感染増強 (ADE)は、治療薬として抗SARS-CoV-2抗体を使用する場合の大きな懸念として存在しています。ADEは、Fcγ受容体が関与して、食細胞における感染を増強した場合に起こります。ADEの可能性を排除するために、Fcγ受容体が関係しない例えばIgG4アイソタイプを使用したり、FcγR-null LALA 変異を人工的に導入するというような手法がとられます。しかしながら、これらの手法は逆効果をもたらし、抗体の持つ能力を下支えするシグナルパス、例えばFcγ受容体を介したADCC効果、を殺してしまうはずです。この問題に答えるために、著者らはSARS-CoV-2回復期患者からRBDに結合する中和抗体IgG1を抽出し(SC31と命名)、その治療効果をそのLALA変異体と比較する実験を行い、SC31はADEを起こすことなく、Fcγ受容体がかかわるINF-γらの抗ウイルス応答を示しました。

SC31の治療効果におけるFcγ受容体を介したエフェクター効果を確認するために、SC31とそのLALA変異体の比較を行っています。 FcγRIIIa ADCCシグナルパスの上流の活性化を評価するために、ADCC reporter assayを組み込んだFcγRIIIaを発現するJurkat reporter 細胞株を使用し、SARS-CoV-2 Spikeを発現するようにしたHEK293T株を共培養して、蛍光を測定しました。SC31のLALA 変異体とは異なり、SC31においては、ドーズ依存性を持ちながらADCCシグナルの活性が見られました。

Galectin-3が腹部大動脈瘤のバイオマーカーになり得る

Taipei Medical University, Taiwanらのグループは、Galectin-3が腹部大動脈瘤の良いマーカーになり得るとしています。
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC8200414/

超音波診断が、AAAの診断に対してはゴールドスタンダードであり、高い感度と特異性を持っています。しかし、その感度は、動脈瘤の大きさで変わりますし、動脈瘤下の大動脈拡張には著音波診断はすいしょうされません。この為、動脈瘤サイズを反映する炎症性の血中バイオマーカーがあれば、動脈瘤の発見や進行を検査するのに役立ちます。

151名の腹部動脈瘤患者と195名の健常者の協力を得て、血中バイオマーカーとしてGal-3とIL-6の横断的な研究が行われました。血中Gal-3の濃度は、腹部大動脈溜の患者で健常者に比べて顕著に高くなっていました(96.9 ± 4.5L vs. 76.5 ± 1.9 ng/mL)、同様に血中IL-6の濃度も腹部大動脈瘤の患者で高くなっていました(92.8 ± 5.2 pg/mL vs. 72.5 ± 3.0 pg/mL)。Gal-3とIL-6の診断能力をROC解析した結果、Gal-3のAUCは0.91となり、IL-6のそれは0.72となりました。

Gal-3 は、マクロファージに対する走行性因子であり、それ故、各種の心血管疾患と関連しています。Gal-3が高値となった腹部動脈瘤患者においては、活性化されたマクロファージなど炎症性免疫細胞の心血管疾患への遊走や更なるGal-sの分泌を意味している可能性もあります。

3種のC-型レクチン、MBP, Langerin, Dectin-2、とMannoseの結合様式について抜粋

東北薬科大のグループは、病原菌認識に関わる11種の哺乳類レクチン受容体についてレビューしています。
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC8185196/

このレビューの中から、3種のC-型レクチンについて、ご参考にまとめてみました。
多くのC-型レクチンはマンノースに対して特異性を示し、病原体の認識に深く関わっています。一つ目のマンノース結合レクチンはMBP(MBLとも呼ばれる)ですが、これは自然免疫の補体経路を活性化するものとして知られています。マンノース修飾は哺乳類のN-型糖鎖で頻繁にみられるものであり、何故MBPが外因性のマンノースを認識できるのか不思議ではないでしょうか? 恐らくこれは、哺乳類のN-型糖鎖に比べて、病原菌のマンノース修飾は密度が高いことに原因があると考えられます。C-型レクチンのドメインは、マンノースのOH3とOH4に配位したCa2+イオンを好みます。そのアフィニティーはKd値が1mMと非常に低く、1:1の反応では免疫反応を引き起こせません。しかしながら、MBPは三量体であり、病原菌に発現する多くの末端マンノースと多価的に反応することができます。MBPの糖鎖結合サイト間の距離は50Åであり、そのような多価的な結合にちょうど良い構造となっています。もうひとつのC-型レクチンであるLangerinの場合には、三量体の結合サイト間の距離は40Åであります。 多価的に結合することによって、単一のマンノース結合に比べて、アフィニティーは何と1,000倍 向上することが分かっています。

Dectin-2も同じようにC-型レクチンですが、DC-SIGN、Langerinなど他のC-型レクチンに比べると、Manα1-2Man 構造をまるっと認識することが異なっています。他のC-型レクチンは、末端のManα1-2Man構造しか認識しないのです。内部のマンノース残基を認識できるということは、Dectin-2 は長いマンナン型糖鎖を認識するに優れていると言えるでしょう。

COVID-19治療薬として、TMPRSS2阻害剤としての低分子化合物 ketobenzothiazole が有力な候補に挙がる

Washington University School of Medicine, Saint Louis, United Statesらのグループは、既存のCamostat and Nafamostatに対しても非常に優れた活性を示す知分子のTMPRSS2阻害剤 ketobenzothiazoleを発見した。そのリードが豪物である MM3122 は、recombinant full-length TMPRSS2に対して、IC50 = 340 pM という阻害効果を示し、ヒトのCalu-3肺上皮細胞へのSARS-CoV-2感染に対してもEC50 = 430 pM という阻害効果を示した。
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC8204910/

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